293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2830 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 303 aa  633  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  80.6 
 
 		 303 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  79.54 
 
 		 311 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  76.25 
 
 		 302 aa  480  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  60.73 
 
 		 312 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  57.67 
 
 		 299 aa  352  2.9999999999999997e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  47.3 
 
 		 300 aa  271  7e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  45.08 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  44.37 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  41.02 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  40.74 
 
 		 297 aa  218  7e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  37.62 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  37.25 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  40.54 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  36.93 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  39.19 
 
 		 297 aa  195  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  37.25 
 
 		 313 aa  192  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  38.26 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  31.92 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  33.22 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  30.43 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  31.15 
 
 		 287 aa  129  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  29.51 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  30.23 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  29.61 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  29.61 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  29.7 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  33.02 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  28.43 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  30.52 
 
 		 323 aa  112  9e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  30.03 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  26.82 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  28.05 
 
 		 311 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  27.39 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  28.71 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  27.06 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  29.17 
 
 		 315 aa  99.8  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  30.15 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  29.17 
 
 		 343 aa  95.9  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  30.43 
 
 		 290 aa  95.5  9e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  30.12 
 
 		 328 aa  95.5  9e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  27.6 
 
 		 363 aa  89.4  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  26.96 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  25.75 
 
 		 309 aa  85.5  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  27.42 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  30.42 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  28.35 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  26.52 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  27.76 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  27.42 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  26.89 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  26.79 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  26.56 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  26.69 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  25.44 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0454  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0339442  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  26.71 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  26.61 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1661  C32 tRNA thiolase  29.57 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1733  C32 tRNA thiolase  29.57 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1405  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.237455 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03846  C32 tRNA thiolase  30.69 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  27.69 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  27.69 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  27.69 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  27.69 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  27.69 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  27.69 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  27.69 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0058  C32 tRNA thiolase  29.17 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  27.69 
 
 		 331 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  26.86 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  26.84 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  26.48 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1271  C32 tRNA thiolase  26.22 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.051738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  26.86 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  25.63 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  26.86 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2064  PP-loop superfamily ATPase  25.45 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  25.09 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  24.91 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  26.45 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  26.45 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  28.04 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  27.8 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0101  C32 tRNA thiolase  26.45 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472408 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1514  PP-loop family protein  29.65 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  26.09 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  27.19 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  25.62 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  27.19 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  29.59 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  26.63 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  30.48 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  30.48 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  26.63 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  29.95 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  25.96 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  27.39 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  25 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>