More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0923 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 328 aa  658    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  42.52 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  42.33 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  41.67 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  38.87 
 
 		 300 aa  195  7e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  39.61 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  36.94 
 
 		 304 aa  189  7e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  36.45 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  39.14 
 
 		 332 aa  186  3e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  37.06 
 
 		 315 aa  186  7e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  36 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  35.03 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  35.88 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  36.31 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  37.79 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  38.75 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  35.03 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  38.36 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  33.23 
 
 		 304 aa  169  7e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  36.27 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  31.97 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  31.91 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  33.12 
 
 		 337 aa  159  7e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  32.27 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  30.82 
 
 		 308 aa  158  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  30.82 
 
 		 308 aa  158  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  33.23 
 
 		 332 aa  158  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  31.25 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  31.79 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  34.84 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  31.44 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  33 
 
 		 323 aa  152  8.999999999999999e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  31.56 
 
 		 288 aa  152  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  31.02 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  31.77 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  29.62 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  31.51 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  32.59 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  34.08 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  29.22 
 
 		 301 aa  142  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  34.1 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  29.47 
 
 		 363 aa  140  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  32.4 
 
 		 309 aa  139  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  31.02 
 
 		 297 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  29.25 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  29.57 
 
 		 422 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  29.41 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  29.64 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  31.43 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  28.57 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  31.79 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  28.21 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  29.57 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  26.07 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  30.49 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  29.26 
 
 		 312 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  30.12 
 
 		 303 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  28.45 
 
 		 252 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2322  PP-loop domain-containing protein  25.64 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.346098 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  30.07 
 
 		 290 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1746  PP-loop family protein  30.81 
 
 		 345 aa  86.3  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0604543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1477  PP-loop family protein  30.81 
 
 		 345 aa  86.3  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170101  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  29.62 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  33.5 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  33.5 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  33.5 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  29.27 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  30.65 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  27.54 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  30.65 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  25.42 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  26.05 
 
 		 235 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  33 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  26.09 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  30.22 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  30.67 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  28.15 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  29.27 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  31.5 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  28.71 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  27.92 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  28.02 
 
 		 252 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  30.41 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0731  PP-loop domain protein  25.21 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1698  PP-loop domain protein  25.91 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  25.64 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  25.64 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2259  PP-loop domain-containing protein  24.14 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000140384  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  24.38 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  33.56 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1062  C32 tRNA thiolase  27.27 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2723  C32 tRNA thiolase  27.27 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  29.96 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  28.86 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  29.96 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  26.92 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  27.71 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0182  PP-loop domain-containing protein  25.98 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  29.5 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1835  ATPase  28.29 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0468047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>