More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1482 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  100 
 
 		 312 aa  648    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  59.6 
 
 		 302 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  60.73 
 
 		 303 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  60.87 
 
 		 311 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  58.56 
 
 		 299 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  56.95 
 
 		 303 aa  347  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  44.15 
 
 		 300 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  40.8 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  40.53 
 
 		 301 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  41.55 
 
 		 304 aa  238  9e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  39.39 
 
 		 323 aa  235  8e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  42.91 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  42.03 
 
 		 307 aa  220  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  38.03 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  38.03 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  39.59 
 
 		 313 aa  212  7.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  39.8 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  38.74 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  32.48 
 
 		 318 aa  159  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  31.1 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  31.37 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  30.9 
 
 		 287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  30.1 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  29.93 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  32.28 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  29.67 
 
 		 302 aa  116  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  27.1 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  28.3 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  31.4 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  27.83 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  28.48 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  27.91 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  27.91 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  26.25 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  28 
 
 		 363 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  29.26 
 
 		 328 aa  99  9e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  30.36 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  28.3 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  28.62 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  30.16 
 
 		 422 aa  96.7  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  26.25 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  28.09 
 
 		 319 aa  95.9  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  29.23 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  26.25 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  30.21 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  29.41 
 
 		 304 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  27.54 
 
 		 326 aa  92.8  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  27.65 
 
 		 315 aa  92.8  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  26.18 
 
 		 332 aa  92.8  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  25.59 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  28.46 
 
 		 376 aa  87  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  27.84 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  26.3 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  26.77 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  26.11 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  26.91 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  31.28 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0454  hypothetical protein  32.76 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0339442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  27.27 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  23.17 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0699  PP-loop family protein  32.64 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.966834  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  25.53 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  26.27 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  30.73 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  26.36 
 
 		 247 aa  68.9  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  32.4 
 
 		 264 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1733  C32 tRNA thiolase  26.73 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  24.13 
 
 		 317 aa  67  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1661  C32 tRNA thiolase  26.73 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  27.59 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  25.64 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  26.87 
 
 		 244 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  28.21 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  28.21 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2259  PP-loop domain-containing protein  24.47 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000140384  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0093  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.16 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  28.44 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  28.67 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1320  PP-loop domain-containing protein  24.18 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  26.99 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  25.11 
 
 		 244 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  25.11 
 
 		 244 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1514  PP-loop family protein  27.51 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0527  PP-loop domain protein  29.19 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  26.59 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0058  C32 tRNA thiolase  27.13 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  28.7 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  25.44 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03846  C32 tRNA thiolase  25.68 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0182  PP-loop  29.03 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  22.12 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  30.67 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  25.55 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0225  PP-loop domain-containing protein  22.71 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0153  PP-loop family protein  26.38 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0100242  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0113  PP-loop family protein  26.38 
 
 		 251 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2579  PP-loop domain protein  28.2 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0282863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  24.9 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  30.67 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  30.67 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>