More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1268 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 323 aa  633  1e-180  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  34.2 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  29.85 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  30.67 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  35.33 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  30 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  38.36 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  32.46 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  35.14 
 
 		 307 aa  165  8e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  32.55 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  31.31 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  33 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  34.23 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  31.89 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  31.89 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  33.44 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  32.34 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  30.13 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  36.43 
 
 		 290 aa  152  8e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  26.33 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  31.21 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  31.89 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  31.77 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  27.36 
 
 		 287 aa  146  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  31.1 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  30.22 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  35.85 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  31.08 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  27.85 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  32.11 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  30.62 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  30.43 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  30.51 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  33.56 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  33.33 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  28.53 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  26.95 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  28.53 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  25.75 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  25.75 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  30.22 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  29.56 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  28.62 
 
 		 311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  27.53 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  29.66 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  28.3 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  26.4 
 
 		 363 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  28.39 
 
 		 330 aa  112  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  32.3 
 
 		 343 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  28.25 
 
 		 319 aa  109  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  28.7 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  29.84 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  32.53 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  29.35 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  29.5 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  29.5 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  29.5 
 
 		 331 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  29.12 
 
 		 331 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  31.33 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  26.94 
 
 		 422 aa  92.8  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  27.34 
 
 		 376 aa  92  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  28.84 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  28.84 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  28.25 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  25.4 
 
 		 252 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  30 
 
 		 336 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  29.44 
 
 		 336 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  28.35 
 
 		 331 aa  89  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  25.21 
 
 		 235 aa  89.4  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  27.97 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  27.97 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  27.97 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  27.97 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  27.97 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  27.97 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  27.97 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  29.55 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0942  PP-loop domain-containing protein  33.68 
 
 		 294 aa  87  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.907512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  30.69 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  29.36 
 
 		 307 aa  85.9  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  28.14 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  24.92 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  28.44 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4089  C32 tRNA thiolase  30.69 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  31.08 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0357  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.38 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  29.88 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  31.22 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  31.84 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1405  C32 tRNA thiolase  27.54 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.237455 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  30.43 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  30.43 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  28.64 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  30.18 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  28.64 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0339  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.49 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  30.13 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  28.64 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  28.64 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  29.63 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>