More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1363 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  100 
 
 		 299 aa  621  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  61.62 
 
 		 311 aa  377  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  59.73 
 
 		 302 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  58.56 
 
 		 312 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  57.67 
 
 		 303 aa  352  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  55.85 
 
 		 303 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  45.08 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  43.77 
 
 		 318 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  43.2 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  41.5 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  44.41 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  40 
 
 		 323 aa  243  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  43.54 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  39.59 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  40.48 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  38.67 
 
 		 304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  42.28 
 
 		 310 aa  222  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  38.46 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  35.33 
 
 		 323 aa  177  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  33.12 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  32.67 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  30.56 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  32.33 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  29.28 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  27.88 
 
 		 311 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  29.61 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  31.6 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  28.52 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  28.29 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  29.01 
 
 		 326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  28.81 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  28.81 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  25.91 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  29.64 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  25.65 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  28.8 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  30.79 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  32.82 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  25.32 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  28.88 
 
 		 319 aa  108  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  28.44 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  29.18 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  27.97 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  25.16 
 
 		 363 aa  105  8e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  27.49 
 
 		 332 aa  105  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  29.1 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  27.8 
 
 		 327 aa  102  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  27.72 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  28.08 
 
 		 332 aa  101  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  28.3 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  30.68 
 
 		 343 aa  99  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  27.07 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  27.15 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  28.97 
 
 		 422 aa  96.7  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  26.48 
 
 		 376 aa  92.4  9e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  29.24 
 
 		 252 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  33.48 
 
 		 282 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  28.22 
 
 		 307 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  27.65 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03846  C32 tRNA thiolase  29.07 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  34.53 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  27.78 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2259  PP-loop domain-containing protein  28.07 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000140384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  30.2 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  28.12 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  31.25 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0454  hypothetical protein  32.09 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0339442  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0175  PP-loop domain-containing protein  28 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1271  C32 tRNA thiolase  28.44 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.051738  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1661  C32 tRNA thiolase  28.63 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  24.43 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  28.12 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  30.98 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1514  PP-loop family protein  28.21 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1320  PP-loop domain-containing protein  26.39 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  25.89 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1733  C32 tRNA thiolase  28.19 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  26.46 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0868  C32 tRNA thiolase  25.91 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0875  C32 tRNA thiolase  25.96 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  27.14 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  27.14 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2579  PP-loop domain protein  30.64 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0282863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  29.08 
 
 		 255 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0554  C32 tRNA thiolase  26.8 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0225  PP-loop domain-containing protein  26.01 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  29.08 
 
 		 255 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1167  C32 tRNA thiolase  25.45 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.958339  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  28.44 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  23.56 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  26.02 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  26.02 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3405  PP-loop domain protein  25.11 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  26.02 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  24.56 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  27.19 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  25.88 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  24.15 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  25.89 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>