296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1255 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 
337 aa  701    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  54.49 
 
 
330 aa  386  1e-106  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  55.79 
 
 
327 aa  381  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  54.94 
 
 
329 aa  369  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  54.49 
 
 
332 aa  369  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  38.22 
 
 
326 aa  188  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  33.04 
 
 
323 aa  182  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  34.73 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  34.38 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  33.65 
 
 
302 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  35.13 
 
 
302 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  32.73 
 
 
326 aa  162  9e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  33.12 
 
 
328 aa  159  7e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  34.15 
 
 
319 aa  159  9e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  31.83 
 
 
304 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  31.13 
 
 
300 aa  155  9e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  32.18 
 
 
311 aa  155  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  32.21 
 
 
311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  31.9 
 
 
311 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  31.41 
 
 
309 aa  153  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  32.4 
 
 
311 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  33.23 
 
 
319 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  30.72 
 
 
308 aa  151  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  30.72 
 
 
308 aa  151  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  32.23 
 
 
321 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  31.15 
 
 
363 aa  150  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  33.96 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  32.48 
 
 
304 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  33.67 
 
 
343 aa  144  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  31.85 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  27.95 
 
 
376 aa  132  6e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  29.58 
 
 
422 aa  129  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  30.91 
 
 
318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  29.11 
 
 
318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  28.25 
 
 
323 aa  120  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  30.85 
 
 
307 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  28.8 
 
 
304 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  28.93 
 
 
304 aa  112  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  27.4 
 
 
287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  29.93 
 
 
297 aa  110  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  27.39 
 
 
304 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  25 
 
 
301 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  28.62 
 
 
297 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  27.97 
 
 
299 aa  106  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  27.95 
 
 
313 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  26.75 
 
 
300 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  30.16 
 
 
282 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  29.93 
 
 
290 aa  100  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  29.49 
 
 
311 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  29.39 
 
 
302 aa  99.4  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  28.3 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  30.1 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  25.32 
 
 
288 aa  96.7  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  30.92 
 
 
264 aa  93.2  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  26.35 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  28.39 
 
 
303 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  27.42 
 
 
259 aa  90.9  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  27.31 
 
 
255 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  27.31 
 
 
255 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  28.05 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  27.64 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  28.4 
 
 
303 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0233  PP-loop domain protein  28.51 
 
 
269 aa  88.6  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  27.64 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  29.8 
 
 
331 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0554  C32 tRNA thiolase  27.95 
 
 
313 aa  87  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  27.97 
 
 
336 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  30.2 
 
 
331 aa  86.7  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  29.8 
 
 
336 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  29.39 
 
 
326 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0815  PP-loop  28.69 
 
 
338 aa  85.9  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  29.8 
 
 
336 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  29.39 
 
 
331 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  29.8 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  29.8 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  29.8 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  29.8 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  29.8 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  28.98 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  24.92 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  29.8 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  29.39 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  29.8 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  28.69 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  26.94 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  28.46 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  26.52 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  28.06 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  26.69 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  27.43 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  25.86 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0527  PP-loop domain protein  28.85 
 
 
250 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  26.05 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  25.86 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  25.86 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4089  C32 tRNA thiolase  28.33 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  26.05 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  26.05 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  26.05 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  27.84 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>