More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1647 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 327 aa  670    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  81.29 
 
 		 332 aa  565  1e-160  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  78.88 
 
 		 330 aa  550  1e-155  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  78.64 
 
 		 329 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  55.79 
 
 		 337 aa  381  1e-105  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  36.66 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  37.79 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  35.67 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  35.26 
 
 		 304 aa  175  7e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  36.01 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  32.92 
 
 		 315 aa  162  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  35.99 
 
 		 300 aa  162  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  34.16 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  32.36 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  35.92 
 
 		 315 aa  153  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  32.17 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  30.48 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  30.48 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  31.97 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  29.17 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  32.48 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  31.29 
 
 		 363 aa  143  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  38.46 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  31.37 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  33.92 
 
 		 422 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  30.25 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  31 
 
 		 326 aa  137  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  29.54 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  30.56 
 
 		 309 aa  133  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  29.19 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  29.85 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  31.85 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  31.83 
 
 		 304 aa  123  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  31.83 
 
 		 304 aa  123  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  28.16 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  30.03 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  27.96 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  29.64 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  30.1 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  29.24 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  26.52 
 
 		 318 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  29.35 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  29.84 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  27.48 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  27.1 
 
 		 287 aa  107  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  27.8 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  30.85 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  30.45 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  29.93 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  25.26 
 
 		 310 aa  93.2  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  24.12 
 
 		 288 aa  90.5  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  27.83 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  28.06 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  31.84 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  28.72 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  28.81 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  28.81 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  26.11 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  31.25 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  32.35 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  32.23 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  27.42 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  26.94 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  31.43 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  27.64 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  30.89 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  31.51 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  30.89 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  31.51 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  28.74 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  27.94 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  27.94 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0233  PP-loop domain protein  24.71 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  27.31 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  31.72 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  28.71 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  28.71 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  28.71 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  28.71 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  29.63 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  31.25 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  29.19 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  29.17 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  26.58 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  26.94 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  31.25 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  27.64 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  28.8 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  25.66 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  22.73 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  30.21 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  30.21 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  29.19 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  29.19 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  29.19 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  29.19 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1271  C32 tRNA thiolase  26.32 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.051738  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  29.19 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  28.23 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>