296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0017 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 304 aa  613  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  75.87 
 
 		 290 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  35.85 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  35.07 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  30.8 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  30.8 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  28.36 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  31.79 
 
 		 328 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  27.65 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  29.43 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  31.8 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  27.56 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  31.07 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  30.72 
 
 		 332 aa  102  7e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  28.04 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  29.41 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  30.22 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  32.51 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  27.15 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  30.1 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  28.78 
 
 		 301 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  29.23 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  31.38 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  29.59 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  29.39 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  28.72 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  27.89 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  31.34 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  26.18 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  28.11 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  28.72 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  30.42 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  30.77 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  30.77 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  30.77 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  30.77 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  30.77 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  30.77 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  30.77 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  29.86 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  25.64 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  30.77 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  30.32 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  30.32 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  30.32 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  29.86 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  29.86 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  29.78 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1835  ATPase  28.04 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  30.39 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  29.86 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  29.7 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  30.67 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  29.85 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  29.85 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  30.22 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  30.22 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  30.22 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  30.22 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  29.33 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  29.73 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1995  C32 tRNA thiolase  28 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0619881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  29.33 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  29.41 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  29.76 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  28.19 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  24.29 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  29.21 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  28.7 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  28.19 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  28.19 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  28.7 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  28.19 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  28.19 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  28.44 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  28.19 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  28.19 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  28.19 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  29.21 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  28.19 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2020  C32 tRNA thiolase  28 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  29.03 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  23.27 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  29.41 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  27.66 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  28.17 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  37.24 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  27.8 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  27.8 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0974  PP-loop domain protein  30 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  27.8 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  27.8 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0772  C32 tRNA thiolase  29.21 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.26194  normal  0.702409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  27.8 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  28.19 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0101  C32 tRNA thiolase  27.93 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472408 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  28.19 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1750  C32 tRNA thiolase  28.5 
 
 		 368 aa  75.9  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000779647 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  27.35 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  28.19 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>