More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1672 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  100 
 
 		 318 aa  652    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  51.14 
 
 		 313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  49.33 
 
 		 300 aa  306  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  48.29 
 
 		 301 aa  299  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  49.83 
 
 		 304 aa  292  5e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  46.42 
 
 		 304 aa  264  1e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  46.42 
 
 		 304 aa  264  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  43.77 
 
 		 299 aa  259  6e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  43 
 
 		 323 aa  255  7e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  43.54 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  40.8 
 
 		 312 aa  246  4e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  39.8 
 
 		 297 aa  242  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  42.86 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  39.8 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  38.8 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  40.68 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  39 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  41.02 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  37.25 
 
 		 318 aa  189  5.999999999999999e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  29.85 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  32.78 
 
 		 302 aa  165  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  33.22 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  34.01 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  33.22 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  30.98 
 
 		 326 aa  158  9e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  31.44 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  30.64 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  35.02 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  29.39 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  31.35 
 
 		 311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  29.61 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  31.76 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  28.43 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  27.8 
 
 		 319 aa  129  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  29.38 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  29.11 
 
 		 337 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  28.62 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  28.15 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  28.48 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  29.61 
 
 		 308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  29.61 
 
 		 308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  29.92 
 
 		 422 aa  116  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  32.47 
 
 		 290 aa  115  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  27.81 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  24.69 
 
 		 332 aa  115  8.999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  29.47 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  26.56 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  27.53 
 
 		 329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  26.84 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  26.58 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  26.27 
 
 		 332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  27.06 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  24.84 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  26.52 
 
 		 327 aa  110  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  24.84 
 
 		 321 aa  105  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  28.04 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  28.87 
 
 		 307 aa  92.4  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0554  C32 tRNA thiolase  29.41 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  26.32 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1661  C32 tRNA thiolase  31.42 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  29.82 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  28.57 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  29.52 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  28.63 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  29.61 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  28.63 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  27.88 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1733  C32 tRNA thiolase  30.97 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1320  PP-loop domain-containing protein  30.92 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  28.63 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  28.63 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  29.52 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  32.16 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  24.68 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  29.03 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  28.33 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0225  PP-loop domain-containing protein  30.8 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  29.57 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  28.23 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  28.51 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  28.23 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  28.08 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0093  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.93 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167197  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  30 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  30 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  28.46 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  26.85 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  29.46 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  30.13 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  28.63 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  28.63 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  28.63 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0974  PP-loop domain protein  29.19 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  27.31 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  29.13 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  29.13 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  29.13 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  28.63 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  29.78 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  28.63 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>