More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_39100 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  100 
 
 		 376 aa  775    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  52.76 
 
 		 422 aa  423  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  57.1 
 
 		 363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  29.7 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  36.61 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  33.24 
 
 		 315 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  32.06 
 
 		 319 aa  146  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  34.25 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  30.81 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  34.96 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  31.67 
 
 		 319 aa  142  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  29.34 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  27.78 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  35.56 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  31.29 
 
 		 326 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  28.4 
 
 		 311 aa  139  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  30.48 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  27.95 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  28.39 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  28.77 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  29.68 
 
 		 329 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  29.19 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  27.67 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  28.86 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  27.41 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  31.32 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  29.02 
 
 		 315 aa  123  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  26.01 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  26.01 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  27.04 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  27.06 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  26.07 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  24.85 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  24.85 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  30.43 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  29.15 
 
 		 300 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  27.84 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  29.76 
 
 		 318 aa  102  8e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  28.14 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  26.81 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  22.73 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  28.24 
 
 		 297 aa  99.4  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  24.62 
 
 		 301 aa  95.9  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  26.48 
 
 		 299 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  27.34 
 
 		 323 aa  92  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  29.39 
 
 		 313 aa  91.3  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  28.9 
 
 		 303 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  28.46 
 
 		 312 aa  87  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  23.81 
 
 		 244 aa  87  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  27.06 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  25.67 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  24.32 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  26.27 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  27 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  26.89 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  24.9 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0182  PP-loop domain-containing protein  26.13 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  26.22 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  25.1 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_4674  predicted protein  27.56 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.594652  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  26.75 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  27.04 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  25.1 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  25.1 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  27.71 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  26.16 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  26.84 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  27.08 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  27.08 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  25.51 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  24.21 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1995  C32 tRNA thiolase  27.23 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0619881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  26.04 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  24.65 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  26.05 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  24.35 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  24.35 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  24.35 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1708  PP-loop domain protein  25.95 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  24.79 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  26.12 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  25 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  24.89 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  24.44 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  24.89 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  25.08 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  25.08 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  25.08 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  27.06 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  25.09 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  26.21 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  24.75 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  24.75 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  25 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  25.09 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  23.32 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  31.58 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  24.68 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  25.81 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>