More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1454 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 
329 aa  678    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  82.97 
 
 
330 aa  569  1e-161  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  80.75 
 
 
332 aa  547  1e-155  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  78.64 
 
 
327 aa  539  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  54.94 
 
 
337 aa  369  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  39.61 
 
 
328 aa  194  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  37.1 
 
 
302 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  34.62 
 
 
304 aa  180  4e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  35.18 
 
 
302 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  35.56 
 
 
326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  37.71 
 
 
343 aa  162  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  32.81 
 
 
315 aa  162  8.000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  35.26 
 
 
300 aa  160  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  33.66 
 
 
308 aa  159  7e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  31.99 
 
 
323 aa  157  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  36.81 
 
 
315 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  30.56 
 
 
363 aa  150  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  28.66 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  28.66 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  30.09 
 
 
311 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  29.62 
 
 
311 aa  145  6e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  31.61 
 
 
319 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  27.56 
 
 
311 aa  140  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  29.62 
 
 
311 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  31.93 
 
 
326 aa  138  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  31.31 
 
 
319 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  32.69 
 
 
304 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  31.1 
 
 
422 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  29.68 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  29.38 
 
 
332 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  30.49 
 
 
321 aa  122  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  30.06 
 
 
309 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  29.32 
 
 
300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  28.75 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  26.86 
 
 
301 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  30.13 
 
 
304 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  29.29 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  31.11 
 
 
318 aa  116  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  29.35 
 
 
304 aa  116  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  29.58 
 
 
304 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  29.66 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  27.53 
 
 
318 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  31.12 
 
 
290 aa  112  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  31.8 
 
 
304 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  28.57 
 
 
307 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  28.43 
 
 
313 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  25.63 
 
 
288 aa  102  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  28.3 
 
 
299 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  25.57 
 
 
287 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  27.8 
 
 
297 aa  97.4  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  30.13 
 
 
302 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  25.94 
 
 
310 aa  94  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  28.3 
 
 
303 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  31.98 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  31.17 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  31.17 
 
 
291 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  27.18 
 
 
311 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  27.84 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  27.42 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  31 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  29.22 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0233  PP-loop domain protein  25.31 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  26.56 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  28.75 
 
 
252 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  27.39 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  29.74 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 
331 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  27.02 
 
 
259 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  26.89 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  26.95 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 
331 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  26.32 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  25.42 
 
 
244 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  25.42 
 
 
244 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  26.32 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  27.2 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  28.7 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  26.32 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  30.54 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  28.14 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  28.92 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  26.32 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  27.87 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3405  PP-loop domain protein  26.72 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  26.32 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  28.7 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0554  C32 tRNA thiolase  27.06 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  25 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  25.91 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  26.4 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  26.4 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.800343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>