More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0970 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  609  1e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  48.99 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  48.83 
 
 		 315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  41.58 
 
 		 302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  40.33 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  40.07 
 
 		 326 aa  208  7e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  38.51 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  38.87 
 
 		 328 aa  195  6e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  35.33 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  41.72 
 
 		 343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  33.55 
 
 		 304 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  34.16 
 
 		 326 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  34.81 
 
 		 319 aa  176  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  34.07 
 
 		 319 aa  175  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  33.33 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  36.86 
 
 		 330 aa  171  9e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  35.71 
 
 		 363 aa  170  3e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  33.88 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  32.62 
 
 		 332 aa  165  9e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  33.55 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  32.24 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  32.13 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  32.13 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  32.89 
 
 		 311 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  35.99 
 
 		 327 aa  162  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  33.77 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  32.6 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  33.22 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  34.08 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  35.26 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  34.43 
 
 		 315 aa  159  7e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  35.21 
 
 		 422 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  31.13 
 
 		 337 aa  155  7e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  32.68 
 
 		 323 aa  152  5e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  30.64 
 
 		 318 aa  152  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  31.77 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  31.74 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  30.43 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  32.2 
 
 		 307 aa  135  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  30.85 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  31.63 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  33.33 
 
 		 299 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  31.23 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  28.91 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  29.37 
 
 		 301 aa  126  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  30.2 
 
 		 302 aa  125  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  29.15 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  29.15 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  29.24 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  30.03 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  31.4 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  29.17 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  27.96 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  30.23 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  31.43 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  31.23 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  30.7 
 
 		 252 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  31.58 
 
 		 237 aa  92  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  29.59 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  35.29 
 
 		 260 aa  90.1  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  31.6 
 
 		 244 aa  89.7  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  30.99 
 
 		 282 aa  89.7  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2259  PP-loop domain-containing protein  32.14 
 
 		 242 aa  89.4  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000140384  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  27.9 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  31.98 
 
 		 247 aa  89.4  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  36.98 
 
 		 259 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  29.87 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  30.18 
 
 		 235 aa  87.8  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  29.1 
 
 		 280 aa  87.4  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  29.3 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1011  PP family ATPase  30.13 
 
 		 240 aa  86.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0407194  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  33.7 
 
 		 289 aa  85.5  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  30.34 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3405  PP-loop domain protein  33.71 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  28.51 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  30.81 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  32.43 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1835  ATPase  30.11 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  29.06 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  31.82 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1391  hypothetical protein  29.95 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.738362  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  31.82 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  33.95 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  29.79 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  33.95 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  33.95 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  28.7 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  29 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  33.51 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  33.33 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  28.51 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  33.33 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  31.39 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  31.39 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.46 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0868  C32 tRNA thiolase  28.07 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0753  C32 tRNA thiolase  30.22 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0554  C32 tRNA thiolase  28.9 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0735  C32 tRNA thiolase  29.67 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0699  PP-loop family protein  28.21 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.966834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>