More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0977 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  100 
 
 
319 aa  654    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  89.66 
 
 
319 aa  580  1.0000000000000001e-165  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  73.9 
 
 
321 aa  483  1e-135  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  68.69 
 
 
332 aa  458  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  67.49 
 
 
326 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  43.17 
 
 
302 aa  272  6e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  42.86 
 
 
302 aa  268  1e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  39.18 
 
 
326 aa  235  9e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  36.45 
 
 
311 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  35.83 
 
 
311 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  34.89 
 
 
308 aa  219  5e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  34.89 
 
 
308 aa  219  5e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  33.85 
 
 
311 aa  216  5e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  36.31 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  35.83 
 
 
311 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  35.99 
 
 
304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  34.6 
 
 
309 aa  186  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.731581 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  35.19 
 
 
323 aa  186  5e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  30.72 
 
 
304 aa  185  9e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  35.03 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  34.49 
 
 
300 aa  179  7e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  33.55 
 
 
343 aa  176  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  34.38 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  34.15 
 
 
337 aa  168  9e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  33.54 
 
 
363 aa  168  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  33.23 
 
 
315 aa  166  5e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  32.52 
 
 
332 aa  155  8e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  31.6 
 
 
330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  31.61 
 
 
329 aa  152  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  32.08 
 
 
376 aa  149  7e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  34.77 
 
 
422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  30.25 
 
 
327 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  30.28 
 
 
304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  29.97 
 
 
304 aa  139  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  29.07 
 
 
318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  29.25 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  28.71 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  28.85 
 
 
304 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  26.1 
 
 
287 aa  129  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  28.21 
 
 
297 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  27.95 
 
 
318 aa  125  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  27.04 
 
 
301 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  29.56 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  28.66 
 
 
307 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  28.3 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  28.88 
 
 
299 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  29.25 
 
 
311 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  26.03 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  24.05 
 
 
313 aa  105  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  27.99 
 
 
312 aa  102  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  26.73 
 
 
302 aa  102  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  27.86 
 
 
303 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  26.96 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2322  PP-loop domain-containing protein  25.86 
 
 
298 aa  92.8  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.346098 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  25.23 
 
 
310 aa  90.9  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  28.77 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0797  PP-loop domain-containing protein  25.36 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0613954  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0175  PP-loop domain-containing protein  24.37 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0330  C32 tRNA thiolase  27.45 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0309  C32 tRNA thiolase  28.29 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0225  PP-loop domain-containing protein  23.97 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1320  PP-loop domain-containing protein  24.18 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  28.63 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  27.75 
 
 
276 aa  77  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2871  C32 tRNA thiolase  27.39 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.77837  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2723  C32 tRNA thiolase  27.68 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1062  C32 tRNA thiolase  27.68 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  25.2 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  25.75 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  25.2 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  25.87 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0125  PP-loop family protein  29.66 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.658918  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0735  C32 tRNA thiolase  26.56 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0753  C32 tRNA thiolase  26.29 
 
 
283 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0153  PP-loop family protein  29.66 
 
 
251 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0100242  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  25.86 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  26.18 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  26.19 
 
 
317 aa  72.4  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  28.31 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  28.05 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1512  C32 tRNA thiolase  27.37 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.8984 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  28.12 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4089  C32 tRNA thiolase  26.32 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  28.31 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  28.05 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  26.09 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  25.22 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  26.09 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  26.09 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  26.09 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  26.09 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  25.2 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  25.75 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0974  PP-loop domain protein  27.21 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  25.3 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  23.53 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  25.78 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  24.34 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0875  C32 tRNA thiolase  28.25 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266881  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  27.23 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>