More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2723 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2723  C32 tRNA thiolase  100 
 
 		 292 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1062  C32 tRNA thiolase  99.66 
 
 		 292 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2871  C32 tRNA thiolase  86.94 
 
 		 292 aa  520  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.77837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0309  C32 tRNA thiolase  84.19 
 
 		 295 aa  503  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0330  C32 tRNA thiolase  81.12 
 
 		 287 aa  477  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0875  C32 tRNA thiolase  79.02 
 
 		 297 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1271  C32 tRNA thiolase  69.52 
 
 		 284 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.051738  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1931  C32 tRNA thiolase  66.67 
 
 		 295 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1512  C32 tRNA thiolase  65.17 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.8984 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0825  C32 tRNA thiolase  67.3 
 
 		 278 aa  377  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.10895  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0831  C32 tRNA thiolase  70.15 
 
 		 293 aa  371  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0824  hypothetical protein  70.15 
 
 		 293 aa  371  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.954938  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2394  C32 tRNA thiolase  70.04 
 
 		 292 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1945  C32 tRNA thiolase  65.41 
 
 		 290 aa  364  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104591  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2154  C32 tRNA thiolase  65.79 
 
 		 289 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  54.85 
 
 		 317 aa  319  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  56.35 
 
 		 310 aa  305  5.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  56.54 
 
 		 316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1405  C32 tRNA thiolase  55.13 
 
 		 274 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.237455 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  55.47 
 
 		 289 aa  301  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  56.63 
 
 		 302 aa  298  5e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  57.66 
 
 		 289 aa  298  8e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  53.7 
 
 		 315 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  55.73 
 
 		 298 aa  297  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  52.04 
 
 		 303 aa  297  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  54.76 
 
 		 307 aa  297  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  53.7 
 
 		 315 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  55.17 
 
 		 310 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  55.25 
 
 		 274 aa  296  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  54.51 
 
 		 311 aa  296  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  54.41 
 
 		 314 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0815  PP-loop  53.96 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  53.97 
 
 		 311 aa  295  4e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  53.97 
 
 		 311 aa  295  4e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  53.97 
 
 		 311 aa  295  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  53.97 
 
 		 311 aa  295  5e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  53.97 
 
 		 311 aa  295  5e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  54.12 
 
 		 311 aa  295  5e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  53.97 
 
 		 311 aa  295  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  53.97 
 
 		 311 aa  295  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  53.7 
 
 		 314 aa  295  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  54.83 
 
 		 274 aa  295  8e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  53.97 
 
 		 311 aa  295  9e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  54.41 
 
 		 340 aa  294  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  54.12 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  51.89 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  54.69 
 
 		 284 aa  294  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  54.18 
 
 		 311 aa  293  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  54.9 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2225  C32 tRNA thiolase  52.29 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  54.12 
 
 		 336 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  55.04 
 
 		 334 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  53.31 
 
 		 312 aa  293  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  53.57 
 
 		 311 aa  293  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  53.64 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0974  PP-loop domain protein  53.65 
 
 		 309 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  54.51 
 
 		 331 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  54.51 
 
 		 331 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  53.33 
 
 		 287 aa  292  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  54.51 
 
 		 331 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  54.51 
 
 		 331 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  54.51 
 
 		 331 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  52.87 
 
 		 279 aa  292  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  54.51 
 
 		 331 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  54.51 
 
 		 331 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  55.2 
 
 		 274 aa  292  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  55.2 
 
 		 274 aa  292  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  54.12 
 
 		 336 aa  292  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  53.17 
 
 		 311 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  53.17 
 
 		 311 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  53.17 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  53.17 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  53.17 
 
 		 311 aa  290  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  54.76 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  53.57 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  53.57 
 
 		 313 aa  290  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  54.12 
 
 		 331 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  54.12 
 
 		 331 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  50.92 
 
 		 302 aa  289  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  53.26 
 
 		 326 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1661  C32 tRNA thiolase  55.42 
 
 		 299 aa  288  6e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0695  C32 tRNA thiolase  51.84 
 
 		 317 aa  288  7e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283768  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  50.55 
 
 		 319 aa  288  7e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  50.96 
 
 		 322 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  51.72 
 
 		 310 aa  287  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  52.96 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  54.37 
 
 		 331 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  50.96 
 
 		 322 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  52.96 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  52.96 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  50.96 
 
 		 322 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  50.97 
 
 		 310 aa  286  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1733  C32 tRNA thiolase  55.02 
 
 		 299 aa  286  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  50.96 
 
 		 322 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  50.96 
 
 		 322 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  50.96 
 
 		 322 aa  286  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  51.19 
 
 		 309 aa  286  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0863  C32 tRNA thiolase  53.57 
 
 		 314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1995  C32 tRNA thiolase  50.96 
 
 		 317 aa  285  5e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0619881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  50.57 
 
 		 310 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>