More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1506 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  100 
 
 		 304 aa  624  1e-178  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  49.83 
 
 		 318 aa  292  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  48.97 
 
 		 313 aa  288  9e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  48.62 
 
 		 301 aa  281  8.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  48.97 
 
 		 300 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  46.82 
 
 		 311 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  47.06 
 
 		 304 aa  272  6e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  45.08 
 
 		 299 aa  270  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  46.41 
 
 		 304 aa  269  4e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  45.73 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  42.28 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  45.48 
 
 		 303 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  44.37 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  41.55 
 
 		 312 aa  238  9e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  40.96 
 
 		 297 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  40.13 
 
 		 318 aa  229  3e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  39.86 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  37.8 
 
 		 307 aa  212  7.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  35.33 
 
 		 300 aa  193  4e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  36.54 
 
 		 310 aa  192  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  30 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  38.16 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  33.23 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  34.9 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  30.42 
 
 		 326 aa  162  9e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  33.11 
 
 		 288 aa  161  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  32.91 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  33.22 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  34.29 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  33.67 
 
 		 315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  28.95 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  29.77 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  28.12 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  29.87 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  31.86 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  31.63 
 
 		 330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  31.85 
 
 		 327 aa  126  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  28.85 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  29.97 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  30.52 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  30.52 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  30.66 
 
 		 343 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  27.56 
 
 		 319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  30.13 
 
 		 329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  28.9 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  25.76 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  29.18 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  29.18 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  30.74 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  28.36 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  28.9 
 
 		 363 aa  109  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  25.45 
 
 		 326 aa  109  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  27.39 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  24.92 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  26.81 
 
 		 376 aa  101  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  28.74 
 
 		 422 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  25.96 
 
 		 307 aa  90.1  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  26.84 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  28.18 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  27.04 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  27.27 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2579  PP-loop domain protein  26.69 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0282863 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  22.89 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  31.77 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  22.89 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  31.77 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  27.73 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  29.22 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  29.22 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1661  C32 tRNA thiolase  31.02 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  32.98 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1733  C32 tRNA thiolase  31.02 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2064  PP-loop superfamily ATPase  27.03 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0207  putative cell cycle control ATPase  25 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  29.95 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  25.53 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  31.32 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  28.81 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  28.11 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  31.32 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  26.82 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  31.07 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1514  PP-loop family protein  28.26 
 
 		 250 aa  72  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  30.93 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  29.28 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  29.69 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  28.81 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  26.14 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  27.16 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2259  PP-loop domain-containing protein  27.63 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000140384  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  31.72 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0974  PP-loop domain protein  29.57 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  28.12 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  30.1 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  29.1 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0815  PP-loop  29.95 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  28.96 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  31.18 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  28.02 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0731  PP-loop domain protein  29.96 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>