More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0601 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 311 aa  628  1e-179  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  91.64 
 
 		 311 aa  586  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  93.89 
 
 		 311 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  71.1 
 
 		 308 aa  475  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  71.1 
 
 		 308 aa  475  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  59.41 
 
 		 311 aa  388  1e-107  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  37.54 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  35.83 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  32.72 
 
 		 326 aa  209  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  38.41 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  34.47 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  33.85 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  36.04 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  33.13 
 
 		 332 aa  198  7.999999999999999e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  33.44 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  35.65 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  32.34 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  33.33 
 
 		 323 aa  176  4e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  31.65 
 
 		 304 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  35.88 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  32.79 
 
 		 315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  32.91 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  32.24 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  31.25 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  32.8 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  31.96 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  32.21 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  34.49 
 
 		 343 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  32.17 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  29.62 
 
 		 329 aa  145  6e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  28.85 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  29.22 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  30.9 
 
 		 297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  28.01 
 
 		 297 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  32.27 
 
 		 422 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  27.67 
 
 		 376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  29.13 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  28.53 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  30.52 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  29.77 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  27.78 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  28.71 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  25.65 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  26.58 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  25.99 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  28.05 
 
 		 303 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  26.85 
 
 		 288 aa  108  9.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  27.39 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  28.25 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  27.36 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  28.52 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  26.56 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  30.38 
 
 		 235 aa  97.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  26.25 
 
 		 312 aa  96.3  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  25.4 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1011  PP family ATPase  29.52 
 
 		 240 aa  86.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0407194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  27.13 
 
 		 264 aa  86.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0175  PP-loop domain-containing protein  30.26 
 
 		 323 aa  85.9  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0153  PP-loop family protein  31.36 
 
 		 251 aa  85.9  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0100242  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0125  PP-loop family protein  30.93 
 
 		 253 aa  85.5  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.658918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  26.79 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  28.63 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  28.63 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  26.79 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  26.97 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2259  PP-loop domain-containing protein  28.11 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000140384  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0113  PP-loop family protein  30.51 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  27.73 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  26 
 
 		 282 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1320  PP-loop domain-containing protein  28.25 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1514  PP-loop family protein  28.74 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  27.27 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0225  PP-loop domain-containing protein  29.3 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1749  PP-loop family protein  27.34 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.10614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2223  PP-loop domain-containing protein  29.39 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  25.52 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0206  conserved hypothetical protein, putative ATPase (PP-loop superfamily)  29.84 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0797  PP-loop domain-containing protein  26.69 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0613954  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1613  PP-loop domain-containing protein  27.19 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0928  PP-loop family protein  29.25 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  25.51 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1391  hypothetical protein  30 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.738362  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2322  PP-loop domain-containing protein  21.55 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.346098 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  25.65 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  26.27 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1080  PP-loop domain protein  26.84 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  0.20171 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0147  PP-loop domain-containing protein  23.69 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  25.82 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0699  PP-loop family protein  34.27 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.966834  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  28.3 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2579  PP-loop domain protein  25.74 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0282863 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  27.15 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1405  C32 tRNA thiolase  27.83 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.237455 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  30.29 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  30.29 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  30.29 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  27.24 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0244  hypothetical protein  26.45 
 
 		 250 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0233  PP-loop domain protein  24.78 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0309  C32 tRNA thiolase  27.52 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>