More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1217 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  100 
 
 		 304 aa  616  1e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  48.99 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  44.26 
 
 		 302 aa  257  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  47.49 
 
 		 315 aa  256  4e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  45.61 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  40.07 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  39.6 
 
 		 326 aa  212  7e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  35.42 
 
 		 326 aa  198  7.999999999999999e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  35.99 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  36.94 
 
 		 328 aa  189  7e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  34.94 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  37.94 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  38.38 
 
 		 343 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  35.23 
 
 		 308 aa  179  5.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  34.85 
 
 		 332 aa  178  8e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  32.66 
 
 		 311 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  32.33 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  31.65 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  29.97 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  29.97 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  31.99 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  30.1 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  33.66 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  31.01 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  32.48 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  30.62 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  31.37 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  29.39 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  36.02 
 
 		 363 aa  139  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  30.94 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  32.69 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  30.29 
 
 		 313 aa  136  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  35.77 
 
 		 422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  29.77 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  32.29 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  33.56 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  30.9 
 
 		 297 aa  125  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  31.32 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  26.35 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  26.94 
 
 		 300 aa  115  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  28.1 
 
 		 304 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  28.1 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  30.79 
 
 		 299 aa  113  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  28.86 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  25.93 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  29.17 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  29.84 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  26.89 
 
 		 288 aa  108  8.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  24.67 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  25.74 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  26.51 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  30.15 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  28.05 
 
 		 303 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  29.41 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2322  PP-loop domain-containing protein  28.2 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.346098 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  29 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  28.69 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  28.14 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  28.71 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  29.96 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  28.63 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  29.84 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  29.84 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  27.18 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  26.87 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  28.22 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  27.52 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  30.61 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  26.64 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  29.95 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2064  PP-loop superfamily ATPase  24.89 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  28.17 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  30.12 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  26.58 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  27.8 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  28.64 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  28.82 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  28.85 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  28.85 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0695  C32 tRNA thiolase  26.98 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283768  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  28.85 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  28.37 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  28.37 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  29.19 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  28.7 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1835  ATPase  27.09 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  28.93 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  26.99 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  28.51 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  28.14 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  29.19 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  28.85 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  27.19 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  26.99 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  26.55 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  26.55 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  27.75 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  25.75 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  28.71 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  26.55 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>