More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0195 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  100 
 
 
301 aa  620  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  73.31 
 
 
300 aa  477  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  48.29 
 
 
318 aa  299  4e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  48.62 
 
 
304 aa  281  8.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  45.39 
 
 
313 aa  266  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  43.73 
 
 
323 aa  264  2e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  44.52 
 
 
311 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  43.2 
 
 
304 aa  257  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  43.2 
 
 
304 aa  255  5e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  43.75 
 
 
303 aa  255  6e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  45.08 
 
 
303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  42.05 
 
 
302 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  41.5 
 
 
299 aa  251  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  40.53 
 
 
312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  38.26 
 
 
310 aa  226  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  37.04 
 
 
307 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  34.92 
 
 
297 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  35.71 
 
 
297 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  35.59 
 
 
288 aa  189  4e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  34.87 
 
 
318 aa  170  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  35.2 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  30.67 
 
 
302 aa  151  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  30.32 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  29.22 
 
 
328 aa  142  5e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  27.85 
 
 
323 aa  142  8e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  28.67 
 
 
302 aa  142  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  28.62 
 
 
326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  29.14 
 
 
308 aa  135  7.000000000000001e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  30.97 
 
 
323 aa  132  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  28.85 
 
 
311 aa  132  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  27.88 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  26.95 
 
 
311 aa  127  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  29.37 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  27.88 
 
 
311 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  28.16 
 
 
332 aa  122  7e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  27.83 
 
 
330 aa  122  7e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  28.16 
 
 
327 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  26.86 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  26.86 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  26.86 
 
 
329 aa  117  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  27.33 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  30.23 
 
 
315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  27.33 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  31.27 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  25.24 
 
 
363 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  27.59 
 
 
343 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  25 
 
 
337 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  25.41 
 
 
315 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  24.67 
 
 
304 aa  105  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  25.59 
 
 
422 aa  102  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  24.69 
 
 
326 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  25.24 
 
 
321 aa  96.7  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  23.05 
 
 
332 aa  96.7  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  24.62 
 
 
376 aa  95.9  8e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  28.78 
 
 
304 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  26.33 
 
 
309 aa  92.4  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  25.64 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  26.94 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  27.76 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  26.07 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2255  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.25 
 
 
470 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000164425  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0872  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.03 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.203605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  26.07 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  25.73 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  27.06 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  29.82 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1514  PP-loop family protein  27.03 
 
 
250 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  24.17 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1011  PP family ATPase  23.55 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0407194  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0454  hypothetical protein  30.06 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0339442  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0093  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.84 
 
 
457 aa  66.2  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167197  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  26.27 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0928  PP-loop family protein  27.35 
 
 
252 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1391  hypothetical protein  26.75 
 
 
260 aa  63.9  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.738362  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0868  C32 tRNA thiolase  29.73 
 
 
256 aa  63.9  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1320  PP-loop domain-containing protein  25.38 
 
 
324 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  23.71 
 
 
235 aa  63.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  23.58 
 
 
317 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  23.58 
 
 
317 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  25.53 
 
 
247 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1810  cell cycle protein MesJ, putative  27.8 
 
 
471 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1749  PP-loop family protein  27.04 
 
 
256 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.10614  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0225  PP-loop domain-containing protein  25 
 
 
324 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  25.42 
 
 
244 aa  62.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  25.42 
 
 
244 aa  62.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1167  C32 tRNA thiolase  29.73 
 
 
256 aa  62.8  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.958339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.45 
 
 
470 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0797  PP-loop domain-containing protein  25 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0613954  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  24.89 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0875  C32 tRNA thiolase  25.52 
 
 
297 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266881  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  24.51 
 
 
259 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  24.54 
 
 
298 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  24.04 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  20.95 
 
 
256 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  20.95 
 
 
260 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  28.41 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  28.41 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  28.41 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  28.41 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  24.59 
 
 
289 aa  60.8  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.318261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>