More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1159 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 297 aa  615  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  57.29 
 
 		 307 aa  351  7e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  53.87 
 
 		 297 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  44.41 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  46.62 
 
 		 302 aa  245  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  39.8 
 
 		 318 aa  242  5e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  42.91 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  40.96 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  43.24 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  40.74 
 
 		 303 aa  218  7e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  43.1 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  38.72 
 
 		 300 aa  215  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  37.79 
 
 		 313 aa  212  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  36.82 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  34.92 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  39.8 
 
 		 310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  35.23 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  34.46 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  36.96 
 
 		 318 aa  185  9e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  34.23 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  31.63 
 
 		 288 aa  152  5e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  30 
 
 		 308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  32.33 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  34.08 
 
 		 328 aa  143  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  32.46 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  28.24 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  30.43 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  29.87 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  31.68 
 
 		 326 aa  132  9e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  31.7 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  28.01 
 
 		 311 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  28.91 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  28.3 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  30.9 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  26.06 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  26.06 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  28.79 
 
 		 319 aa  122  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  28.17 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  27.04 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  29.03 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  27.36 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  29.29 
 
 		 329 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  28.32 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  27.78 
 
 		 323 aa  113  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  29.24 
 
 		 327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  30.04 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  28.43 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  26.91 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  29.93 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  27.84 
 
 		 376 aa  105  9e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  26.97 
 
 		 332 aa  104  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  28.66 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  29.41 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  28.16 
 
 		 422 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  28.97 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  29.34 
 
 		 343 aa  97.1  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  27.86 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1405  C32 tRNA thiolase  28.88 
 
 		 274 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.237455 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0554  C32 tRNA thiolase  28.8 
 
 		 313 aa  86.3  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  27.08 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  23.24 
 
 		 252 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03846  C32 tRNA thiolase  29.65 
 
 		 305 aa  85.9  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  29.68 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0875  C32 tRNA thiolase  28.69 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  28.87 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  25.44 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1661  C32 tRNA thiolase  28.05 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  26.01 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  29.72 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0058  C32 tRNA thiolase  29.29 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  29.29 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  26.86 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  28.29 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  29.58 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  29.58 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  27.87 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  27.78 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  26.47 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1733  C32 tRNA thiolase  27.6 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  27.45 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  28.26 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  28.51 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  27.94 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  27.73 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1011  PP family ATPase  27.54 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0407194  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  26.89 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  27.95 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  28.89 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2064  PP-loop superfamily ATPase  26.2 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  25.19 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  28.82 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1062  C32 tRNA thiolase  29.73 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  26.95 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0815  PP-loop  26.47 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  27.69 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2723  C32 tRNA thiolase  29.73 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  28.7 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0928  PP-loop family protein  28.21 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2223  PP-loop domain-containing protein  33.49 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>