40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1195 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1195  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 259 aa  519  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  37.31 
 
 		 343 aa  143  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  34.43 
 
 		 326 aa  122  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2322  PP-loop domain-containing protein  34.35 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.346098 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  31.7 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  29.67 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  23.48 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1352  hypothetical protein  29.88 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000857544 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  25.71 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  28.37 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  26.48 
 
 		 332 aa  75.5  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  32.98 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  29.14 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  25.34 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2602  hypothetical protein  28.05 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  21.53 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  21.53 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  28.57 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  28.37 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  24.38 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  22.56 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  23.16 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  23.78 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  24.65 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  25.35 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  28.7 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  21.43 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  27.17 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  22.18 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  28.49 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  20.97 
 
 		 311 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  28.88 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  22.75 
 
 		 476 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  25.52 
 
 		 323 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1229  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.06 
 
 		 476 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5246  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  22.75 
 
 		 476 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  28.02 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  28.02 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 1106 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  22.75 
 
 		 476 aa  42  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>