More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2154 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2154  C32 tRNA thiolase  100 
 
 		 289 aa  593  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1945  C32 tRNA thiolase  96.55 
 
 		 290 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104591  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1931  C32 tRNA thiolase  86.88 
 
 		 295 aa  505  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1512  C32 tRNA thiolase  85.77 
 
 		 293 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.8984 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1271  C32 tRNA thiolase  80.73 
 
 		 284 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.051738  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0831  C32 tRNA thiolase  79.78 
 
 		 293 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0824  hypothetical protein  79.78 
 
 		 293 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.954938  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0825  C32 tRNA thiolase  73.21 
 
 		 278 aa  414  9.999999999999999e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.10895  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2394  C32 tRNA thiolase  79.85 
 
 		 292 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0875  C32 tRNA thiolase  68.84 
 
 		 297 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0330  C32 tRNA thiolase  64.26 
 
 		 287 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2871  C32 tRNA thiolase  65.56 
 
 		 292 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.77837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1062  C32 tRNA thiolase  65.79 
 
 		 292 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2723  C32 tRNA thiolase  65.79 
 
 		 292 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0309  C32 tRNA thiolase  65.07 
 
 		 295 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  54.75 
 
 		 317 aa  310  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  56.69 
 
 		 315 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  56.69 
 
 		 315 aa  298  8e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  53.73 
 
 		 310 aa  296  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  54.23 
 
 		 274 aa  295  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  55.29 
 
 		 313 aa  295  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  54.65 
 
 		 313 aa  295  5e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  55.56 
 
 		 302 aa  295  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0815  PP-loop  53.31 
 
 		 338 aa  295  7e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  55.91 
 
 		 312 aa  293  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  56.76 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  53.85 
 
 		 274 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  49.83 
 
 		 317 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  54.65 
 
 		 311 aa  292  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  56.37 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  56.37 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  56.37 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  56.37 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  56.37 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  56.37 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  54.26 
 
 		 274 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  56.37 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  54.65 
 
 		 311 aa  292  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  54.65 
 
 		 311 aa  292  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  49.83 
 
 		 317 aa  292  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  54.72 
 
 		 284 aa  292  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  54.65 
 
 		 311 aa  292  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  54.65 
 
 		 311 aa  292  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  54.65 
 
 		 311 aa  292  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  54.65 
 
 		 311 aa  292  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  53.28 
 
 		 311 aa  292  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0101  C32 tRNA thiolase  56.92 
 
 		 326 aa  291  7e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  56.13 
 
 		 336 aa  291  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  54.23 
 
 		 274 aa  290  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  54.26 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  54.65 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  54.12 
 
 		 303 aa  290  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  53.88 
 
 		 311 aa  290  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  51.38 
 
 		 334 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  53.88 
 
 		 311 aa  290  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  51.38 
 
 		 340 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  53.88 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  55.56 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  55.56 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  54.12 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  53.88 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  55.56 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  53.88 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  50.68 
 
 		 331 aa  289  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  51.06 
 
 		 316 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  54.76 
 
 		 310 aa  289  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  54.55 
 
 		 279 aa  289  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  56.8 
 
 		 302 aa  288  6e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  53.57 
 
 		 311 aa  288  7e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  54.83 
 
 		 336 aa  288  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  53.28 
 
 		 314 aa  288  9e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  54.05 
 
 		 331 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0863  C32 tRNA thiolase  54.26 
 
 		 314 aa  288  1e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  55.6 
 
 		 298 aa  286  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  54.55 
 
 		 331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  53.52 
 
 		 312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1405  C32 tRNA thiolase  54.41 
 
 		 274 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.237455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  53.67 
 
 		 326 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  54.94 
 
 		 336 aa  285  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  54.15 
 
 		 331 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  52.69 
 
 		 302 aa  285  8e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0554  C32 tRNA thiolase  56.52 
 
 		 313 aa  284  9e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  57.49 
 
 		 289 aa  285  9e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  53.91 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  51.92 
 
 		 274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  52.33 
 
 		 274 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  50.78 
 
 		 313 aa  282  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  51.76 
 
 		 319 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1708  PP-loop domain protein  51.54 
 
 		 302 aa  282  5.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  52.73 
 
 		 274 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  51.15 
 
 		 274 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  51.35 
 
 		 287 aa  281  9e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  50.77 
 
 		 274 aa  281  9e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  52.73 
 
 		 274 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  54.09 
 
 		 289 aa  280  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  51.92 
 
 		 274 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  53.36 
 
 		 310 aa  279  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  52.59 
 
 		 322 aa  279  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0695  C32 tRNA thiolase  52.51 
 
 		 317 aa  279  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283768  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  52.59 
 
 		 322 aa  279  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>