More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2394 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2394  C32 tRNA thiolase  100 
 
 		 292 aa  603  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0831  C32 tRNA thiolase  93.15 
 
 		 293 aa  521  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0824  hypothetical protein  93.15 
 
 		 293 aa  521  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.954938  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1271  C32 tRNA thiolase  80 
 
 		 284 aa  471  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.051738  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0825  C32 tRNA thiolase  82.64 
 
 		 278 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.10895  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1931  C32 tRNA thiolase  74.91 
 
 		 295 aa  441  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1512  C32 tRNA thiolase  76.98 
 
 		 293 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.8984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2154  C32 tRNA thiolase  79.85 
 
 		 289 aa  431  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1945  C32 tRNA thiolase  77.41 
 
 		 290 aa  427  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104591  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0875  C32 tRNA thiolase  69.6 
 
 		 297 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0309  C32 tRNA thiolase  68.35 
 
 		 295 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1062  C32 tRNA thiolase  70.04 
 
 		 292 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2723  C32 tRNA thiolase  70.04 
 
 		 292 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2871  C32 tRNA thiolase  69.66 
 
 		 292 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.77837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0330  C32 tRNA thiolase  67.4 
 
 		 287 aa  385  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  57.77 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  56.86 
 
 		 310 aa  310  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0815  PP-loop  54.06 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  56.02 
 
 		 336 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  55.51 
 
 		 336 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  56.02 
 
 		 331 aa  308  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  55.64 
 
 		 331 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  55.64 
 
 		 331 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  55.64 
 
 		 331 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  57.79 
 
 		 302 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  55.64 
 
 		 331 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  55.51 
 
 		 336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  55.64 
 
 		 331 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  55.64 
 
 		 331 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  55.64 
 
 		 331 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  56.25 
 
 		 311 aa  305  6e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  59.52 
 
 		 289 aa  305  7e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  57.03 
 
 		 313 aa  305  8.000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  55.64 
 
 		 274 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  56.97 
 
 		 311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  55.64 
 
 		 274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  55.64 
 
 		 274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  57.03 
 
 		 310 aa  302  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0554  C32 tRNA thiolase  56.23 
 
 		 313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  55.86 
 
 		 311 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  55.08 
 
 		 311 aa  300  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  55.08 
 
 		 311 aa  300  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  55.08 
 
 		 311 aa  300  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  55.08 
 
 		 311 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  56.52 
 
 		 279 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  55.08 
 
 		 311 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  55.08 
 
 		 311 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  55.08 
 
 		 311 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  54.04 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  54.86 
 
 		 274 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  56.57 
 
 		 313 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  54.04 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  55.08 
 
 		 311 aa  299  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  53.31 
 
 		 331 aa  299  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  55.08 
 
 		 311 aa  299  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  53.96 
 
 		 314 aa  299  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0101  C32 tRNA thiolase  56.6 
 
 		 326 aa  298  5e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472408 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  55.47 
 
 		 311 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  55.47 
 
 		 311 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1708  PP-loop domain protein  55 
 
 		 302 aa  298  7e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  55.47 
 
 		 311 aa  298  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  56.57 
 
 		 313 aa  298  8e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  56.57 
 
 		 313 aa  298  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  56.57 
 
 		 313 aa  298  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  55.47 
 
 		 311 aa  298  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  55.3 
 
 		 298 aa  297  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  55.47 
 
 		 311 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  56.4 
 
 		 302 aa  297  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  52.94 
 
 		 331 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  55.38 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  58.1 
 
 		 289 aa  296  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02293  C32 tRNA thiolase  53.46 
 
 		 297 aa  296  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  49.49 
 
 		 316 aa  295  6e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  52.57 
 
 		 326 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  52.57 
 
 		 331 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  53.54 
 
 		 322 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  52.92 
 
 		 274 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  53.31 
 
 		 274 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  54.37 
 
 		 302 aa  293  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  53.54 
 
 		 322 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  53.54 
 
 		 322 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  54.33 
 
 		 310 aa  293  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003477  tRNA(Cytosine32)-2-thiocytidine synthetase  52.69 
 
 		 297 aa  292  4e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0168289  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  53.78 
 
 		 315 aa  292  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  52.21 
 
 		 331 aa  292  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  52.81 
 
 		 319 aa  292  5e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2225  C32 tRNA thiolase  52.29 
 
 		 310 aa  291  7e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28353 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  53.54 
 
 		 310 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  53.54 
 
 		 310 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  53.78 
 
 		 315 aa  291  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  54.58 
 
 		 322 aa  291  9e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  54.58 
 
 		 322 aa  291  9e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  54.58 
 
 		 322 aa  291  9e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  52.47 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1405  C32 tRNA thiolase  56.64 
 
 		 274 aa  290  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.237455 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  53.94 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  53.96 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  54.18 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  54.44 
 
 		 303 aa  289  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0863  C32 tRNA thiolase  54.3 
 
 		 314 aa  289  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>