More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3393 on replicon NC_013531
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013531  Xcel_3393  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
273 aa  555  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  45.45 
 
 
278 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0017648  normal  0.150799 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5808  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  45.45 
 
 
278 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000032081 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5428  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.53 
 
 
277 aa  228  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  27.23 
 
 
428 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  25.51 
 
 
428 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  27.78 
 
 
441 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0763  IbrA protein  28.26 
 
 
411 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.216199  normal  0.291619 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0717  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  28.38 
 
 
411 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0702  IbrA protein  28.38 
 
 
411 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0658  IbrA protein  28.38 
 
 
411 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  24.69 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  24.59 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0644  IbrA protein  27.83 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0812  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.42 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  28.49 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02570  hypothetical protein  28.02 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02607  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.02 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0926  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.02 
 
 
244 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.518681  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3113  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.02 
 
 
244 aa  67  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0950  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.02 
 
 
244 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2902  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.02 
 
 
244 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2890  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.02 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3064  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.02 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.696985  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4761  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.02 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  28.45 
 
 
594 aa  66.2  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0654  IbrA protein  27.6 
 
 
406 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.533054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3041  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.6 
 
 
406 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3022  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.82 
 
 
406 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0716  sulfate adenylyltransferase, small subunit  29.19 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.284708  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0623  IbrA protein  27.6 
 
 
406 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0688  IbrA protein  27.82 
 
 
406 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49112  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4016  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.59 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.634763  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2865  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.17 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.574909 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00003  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.62 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  28.57 
 
 
594 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0623  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  26.84 
 
 
406 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4543  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.34 
 
 
293 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.591012 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2797  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.01 
 
 
253 aa  63.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000737021  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3141  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.6 
 
 
244 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.682 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3076  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.32 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3157  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.23 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.267465 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3258  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.6 
 
 
244 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002352  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  25.87 
 
 
259 aa  63.5  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000919211  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  26.18 
 
 
592 aa  63.5  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3100  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.23 
 
 
244 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.337134  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2182  sulfate adenylyltransferase subunit 2  25.13 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3225  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.19 
 
 
244 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02131  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.61 
 
 
241 aa  61.6  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0255066  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.78 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  29.79 
 
 
614 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4661  sulfate adenylyltransferase, small subunit  30.32 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423363  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03587  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.68 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.845085  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02176  hypothetical protein  26.81 
 
 
416 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.219036 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2773  sulfate adenylyltransferase, small subunit  27.81 
 
 
308 aa  60.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12810  sulfate adenylyltransferase subunit 2  27.66 
 
 
306 aa  59.7  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.62 
 
 
244 aa  59.7  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.62 
 
 
244 aa  59.7  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.480804  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2422  sulfate adenylyltransferase subunit 2  26.15 
 
 
316 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0216  phosophoadenylyl-sulfate reductase  25.67 
 
 
245 aa  59.3  0.00000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2114  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  26.09 
 
 
245 aa  59.3  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.388893 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  27.23 
 
 
588 aa  59.3  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2451  sulfate adenylyltransferase subunit 2  25.53 
 
 
322 aa  58.9  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4083  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.7 
 
 
251 aa  58.9  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0260  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.32 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  26.34 
 
 
469 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3703  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.81 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0934  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.67 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0636738  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  25.77 
 
 
464 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.26 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6268  sulfate adenylyltransferase subunit 2  28.34 
 
 
305 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.183777 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.44 
 
 
784 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1618  sulfate adenylyltransferase subunit 2  29.5 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2328  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.77 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000480323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2280  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  22.87 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0503527  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1929  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.77 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0556213  hitchhiker  0.0000000000165041 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.59 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0641444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3442  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.77 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0646773  hitchhiker  0.00239136 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0604  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.14 
 
 
218 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0750  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.63 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.32 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0801  sulfate adenylyltransferase subunit 2  25.13 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2142  sulfate adenylyltransferase subunit 2  25.67 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0113655  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1769  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.77 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000122122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3179  hypothetical protein  25.93 
 
 
408 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0877  sulfate adenylyltransferase subunit 2  24.08 
 
 
305 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1125  immunoglobulin-binding regulator A-like protein  26.09 
 
 
410 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0856392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37070  hypothetical protein  26.09 
 
 
408 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  22.46 
 
 
256 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3943  sulfate adenylyltransferase subunit 2  27.32 
 
 
301 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41840  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.77 
 
 
267 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.9 
 
 
580 aa  56.2  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0860  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.89 
 
 
244 aa  56.2  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23150  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.6 
 
 
244 aa  56.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0890  sulfate adenylyltransferase subunit 2  24.62 
 
 
305 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1318  sulfate adenylyltransferase subunit 2  27.03 
 
 
308 aa  56.2  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.237649  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.91 
 
 
268 aa  56.2  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.572293  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4433  sulfate adenylate transferase, subunit 2  24.61 
 
 
305 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4128  sulfate adenylyltransferase subunit 2  24.61 
 
 
305 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  48.08 
 
 
469 aa  55.8  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>