28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3179 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_37070  hypothetical protein  88.24 
 
 
408 aa  755    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3179  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  836    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02176  hypothetical protein  73.43 
 
 
416 aa  596  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.219036 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1579  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  47.28 
 
 
396 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3153  immunoglobulin-binding regulator A  42.23 
 
 
408 aa  278  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1125  immunoglobulin-binding regulator A-like protein  41.55 
 
 
410 aa  270  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0856392 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1385  IbrA  40.39 
 
 
410 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.576852 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0702  IbrA protein  40.2 
 
 
411 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0717  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  40.2 
 
 
411 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0763  IbrA protein  40 
 
 
411 aa  252  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.216199  normal  0.291619 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0658  IbrA protein  39.95 
 
 
411 aa  252  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0623  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  38.54 
 
 
406 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0644  IbrA protein  39.95 
 
 
411 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3041  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.54 
 
 
406 aa  250  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0688  IbrA protein  38.78 
 
 
406 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49112  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0623  IbrA protein  38.54 
 
 
406 aa  249  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3022  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.54 
 
 
406 aa  249  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0654  IbrA protein  38.69 
 
 
406 aa  247  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.533054  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0783  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.95 
 
 
431 aa  226  5.0000000000000005e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00559  hypothetical protein  38.11 
 
 
356 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0408138  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1538  phosphoadenosine phosphosulfate sulfotransferase  29.16 
 
 
440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0166754  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00570  hypothetical protein  37.87 
 
 
353 aa  212  9e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3393  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.93 
 
 
273 aa  57  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  23.83 
 
 
428 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6448  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.18 
 
 
286 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168639  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  22.9 
 
 
428 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11311  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.16 
 
 
332 aa  43.5  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2271  sulfate adenylyltransferase subunit 2  35.53 
 
 
309 aa  43.1  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303386  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>