23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00570 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3022  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  99.72 
 
 		 406 aa  743    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00559  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  743    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0408138  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0688  IbrA protein  99.43 
 
 		 406 aa  742    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0654  IbrA protein  99.72 
 
 		 406 aa  742    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.533054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0623  IbrA protein  99.72 
 
 		 406 aa  744    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3041  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 		 406 aa  745    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0623  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  98.58 
 
 		 406 aa  739    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0763  IbrA protein  83.33 
 
 		 411 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.216199  normal  0.291619 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00570  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  742    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0702  IbrA protein  82.49 
 
 		 411 aa  631  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0644  IbrA protein  82.49 
 
 		 411 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0717  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  82.49 
 
 		 411 aa  631  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0658  IbrA protein  82.49 
 
 		 411 aa  631  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3153  immunoglobulin-binding regulator A  60.11 
 
 		 408 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1125  immunoglobulin-binding regulator A-like protein  60.4 
 
 		 410 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0856392 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1385  IbrA  59.26 
 
 		 410 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.576852 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1579  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  43.64 
 
 		 396 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3179  hypothetical protein  37.87 
 
 		 408 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37070  hypothetical protein  36.92 
 
 		 408 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02176  hypothetical protein  35.71 
 
 		 416 aa  196  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.219036 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0783  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.08 
 
 		 431 aa  181  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1538  phosphoadenosine phosphosulfate sulfotransferase  28.42 
 
 		 440 aa  166  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0166754  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3393  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.11 
 
 		 273 aa  46.6  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>