32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0658 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3022  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  82.06 
 
 		 406 aa  719    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00559  hypothetical protein  82.35 
 
 		 356 aa  635    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0408138  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0688  IbrA protein  82.06 
 
 		 406 aa  719    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0702  IbrA protein  99.76 
 
 		 411 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0644  IbrA protein  99.76 
 
 		 411 aa  864    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0763  IbrA protein  99.03 
 
 		 411 aa  859    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.216199  normal  0.291619 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0717  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  99.76 
 
 		 411 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0658  IbrA protein  100 
 
 		 411 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0623  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  81.82 
 
 		 406 aa  723    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3041  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  82.31 
 
 		 406 aa  722    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0654  IbrA protein  82.06 
 
 		 406 aa  718    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.533054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0623  IbrA protein  82.06 
 
 		 406 aa  720    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00570  hypothetical protein  82.49 
 
 		 353 aa  631  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1125  immunoglobulin-binding regulator A-like protein  60.34 
 
 		 410 aa  528  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0856392 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3153  immunoglobulin-binding regulator A  58.52 
 
 		 408 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1385  IbrA  59.7 
 
 		 410 aa  519  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.576852 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1579  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  43.39 
 
 		 396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3179  hypothetical protein  39.95 
 
 		 408 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37070  hypothetical protein  39.19 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02176  hypothetical protein  38.62 
 
 		 416 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.219036 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0783  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.73 
 
 		 431 aa  216  5.9999999999999996e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1538  phosphoadenosine phosphosulfate sulfotransferase  29.84 
 
 		 440 aa  184  4.0000000000000006e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0166754  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3393  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.38 
 
 		 273 aa  75.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.66 
 
 		 220 aa  53.5  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238936  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5428  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.68 
 
 		 277 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.58 
 
 		 278 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0017648  normal  0.150799 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5808  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.58 
 
 		 278 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000032081 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4761  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.35 
 
 		 253 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2585  sulfate adenylyltransferase subunit 2  22.32 
 
 		 293 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2970  sulfate adenylyltransferase subunit 2  22.32 
 
 		 293 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  23.81 
 
 		 495 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  26.69 
 
 		 633 aa  43.1  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>