25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_37070 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_37070  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  833    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3179  hypothetical protein  88.24 
 
 
408 aa  755    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02176  hypothetical protein  73.87 
 
 
416 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.219036 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1579  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  45.77 
 
 
396 aa  346  5e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3153  immunoglobulin-binding regulator A  41.77 
 
 
408 aa  273  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1125  immunoglobulin-binding regulator A-like protein  41.06 
 
 
410 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0856392 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1385  IbrA  38.69 
 
 
410 aa  256  5e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.576852 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0702  IbrA protein  39.44 
 
 
411 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0717  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  39.44 
 
 
411 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0763  IbrA protein  39.19 
 
 
411 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.216199  normal  0.291619 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0658  IbrA protein  39.19 
 
 
411 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0644  IbrA protein  39.19 
 
 
411 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3041  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.99 
 
 
406 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3022  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.99 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0623  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  37.11 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0623  IbrA protein  36.99 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0688  IbrA protein  37.37 
 
 
406 aa  244  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49112  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0654  IbrA protein  37.15 
 
 
406 aa  243  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.533054  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0783  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.79 
 
 
431 aa  224  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1538  phosphoadenosine phosphosulfate sulfotransferase  30.58 
 
 
440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0166754  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00559  hypothetical protein  36.93 
 
 
356 aa  213  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0408138  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00570  hypothetical protein  36.92 
 
 
353 aa  209  9e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3393  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.09 
 
 
273 aa  57  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4112  sulfate adenylyltransferase subunit 2  22.73 
 
 
293 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  25 
 
 
503 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>