30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1125 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1385  IbrA  91.22 
 
 		 410 aa  789    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.576852 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3153  immunoglobulin-binding regulator A  95.06 
 
 		 408 aa  810    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1125  immunoglobulin-binding regulator A-like protein  100 
 
 		 410 aa  856    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0856392 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0658  IbrA protein  60.34 
 
 		 411 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0702  IbrA protein  60.34 
 
 		 411 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0644  IbrA protein  60.34 
 
 		 411 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0763  IbrA protein  60.1 
 
 		 411 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.216199  normal  0.291619 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0717  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  60.34 
 
 		 411 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0623  IbrA protein  59.11 
 
 		 406 aa  522  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3022  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  58.87 
 
 		 406 aa  520  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0688  IbrA protein  58.87 
 
 		 406 aa  519  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0623  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  58.37 
 
 		 406 aa  518  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3041  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  58.87 
 
 		 406 aa  521  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0654  IbrA protein  58.62 
 
 		 406 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.533054  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00559  hypothetical protein  60.11 
 
 		 356 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0408138  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00570  hypothetical protein  60.4 
 
 		 353 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1579  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.24 
 
 		 396 aa  332  6e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3179  hypothetical protein  41.55 
 
 		 408 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37070  hypothetical protein  41.06 
 
 		 408 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02176  hypothetical protein  40.25 
 
 		 416 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.219036 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0783  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.55 
 
 		 431 aa  223  4.9999999999999996e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1538  phosphoadenosine phosphosulfate sulfotransferase  31.04 
 
 		 440 aa  208  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0166754  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3393  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.09 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  27.44 
 
 		 796 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  26.7 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  24.4 
 
 		 391 aa  47.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  26.57 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5428  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.42 
 
 		 277 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  28.08 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.73 
 
 		 220 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>