42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02176 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02176  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  856    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.219036 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37070  hypothetical protein  73.87 
 
 		 408 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3179  hypothetical protein  73.43 
 
 		 408 aa  618  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1579  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.14 
 
 		 396 aa  323  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3153  immunoglobulin-binding regulator A  40.3 
 
 		 408 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1125  immunoglobulin-binding regulator A-like protein  40.66 
 
 		 410 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0856392 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1385  IbrA  40.4 
 
 		 410 aa  260  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.576852 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0763  IbrA protein  38.36 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.216199  normal  0.291619 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0658  IbrA protein  38.36 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0717  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  38.36 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0702  IbrA protein  38.36 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0644  IbrA protein  38.36 
 
 		 411 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0623  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  36.27 
 
 		 406 aa  238  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3041  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.53 
 
 		 406 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0623  IbrA protein  36.53 
 
 		 406 aa  238  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3022  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.53 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0688  IbrA protein  36.53 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0654  IbrA protein  36.79 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.533054  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0783  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.51 
 
 		 431 aa  228  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1538  phosphoadenosine phosphosulfate sulfotransferase  31.66 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0166754  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00559  hypothetical protein  35.26 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0408138  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00570  hypothetical protein  35.71 
 
 		 353 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3393  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.81 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3123  sulfate adenylyltransferase subunit 2  26.77 
 
 		 304 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.478568  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2818  sulfate adenylyltransferase subunit 2  26.62 
 
 		 322 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000664267 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2773  sulfate adenylyltransferase, small subunit  27.43 
 
 		 308 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  24 
 
 		 503 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1120  sulfate adenylyltransferase subunit 2  24.52 
 
 		 316 aa  45.8  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4112  sulfate adenylyltransferase subunit 2  25 
 
 		 293 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.27 
 
 		 278 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0017648  normal  0.150799 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6448  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.89 
 
 		 286 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5808  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.27 
 
 		 278 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000032081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0833  sulfate adenylyltransferase subunit 2  24.6 
 
 		 301 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137161  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4654  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  32.56 
 
 		 252 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.550549  hitchhiker  0.00181688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2734  sulfate adenylyltransferase subunit 2  23.61 
 
 		 304 aa  43.9  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0448495  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3168  sulfate adenylyltransferase, small subunit  26.55 
 
 		 316 aa  43.1  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.41 
 
 		 342 aa  43.1  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0157  sulfate adenylyltransferase subunit 2  25 
 
 		 303 aa  43.1  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0142128  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1017  sulfate adenylyltransferase subunit 2  24.78 
 
 		 300 aa  43.1  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.705101 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09980  sulfate adenylyltransferase subunit 2  25.6 
 
 		 311 aa  43.1  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2988  sulfate adenylyltransferase subunit 2  22.09 
 
 		 301 aa  43.1  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0558  sulfate adenylyltransferase subunit 2  25 
 
 		 317 aa  43.1  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.652412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>