34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1579 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1579  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
396 aa  825    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3179  hypothetical protein  47.28 
 
 
408 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37070  hypothetical protein  45.77 
 
 
408 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3153  immunoglobulin-binding regulator A  47.87 
 
 
408 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1125  immunoglobulin-binding regulator A-like protein  48.24 
 
 
410 aa  332  6e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0856392 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1385  IbrA  48.34 
 
 
410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.576852 
 
 
-
 
NC_003296  RS02176  hypothetical protein  43.72 
 
 
416 aa  325  6e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.219036 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3041  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  43.31 
 
 
406 aa  310  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0623  IbrA protein  43.31 
 
 
406 aa  309  5e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3022  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  43.04 
 
 
406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0623  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  43.27 
 
 
406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0688  IbrA protein  43.27 
 
 
406 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49112  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0654  IbrA protein  43.04 
 
 
406 aa  305  7e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.533054  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0644  IbrA protein  43.39 
 
 
411 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0763  IbrA protein  43.39 
 
 
411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.216199  normal  0.291619 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0717  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  43.39 
 
 
411 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0702  IbrA protein  43.39 
 
 
411 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0658  IbrA protein  43.39 
 
 
411 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0783  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.44 
 
 
431 aa  297  3e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00559  hypothetical protein  43.64 
 
 
356 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0408138  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00570  hypothetical protein  43.64 
 
 
353 aa  273  6e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1538  phosphoadenosine phosphosulfate sulfotransferase  34.32 
 
 
440 aa  255  9e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0166754  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2271  sulfate adenylyltransferase subunit 2  25.51 
 
 
309 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303386  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11311  sulfate adenylyltransferase subunit 2  26.61 
 
 
332 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4423  sulfate adenylyltransferase subunit 2  24.49 
 
 
309 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0794  sulfate adenylyltransferase subunit 2  29.05 
 
 
304 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0932  sulfate adenylyltransferase, small subunit  21.68 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338545  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1696  sulfate adenylyltransferase, small subunit  25.61 
 
 
300 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.162014  normal  0.427374 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3123  sulfate adenylyltransferase subunit 2  23.6 
 
 
304 aa  43.9  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.478568  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0558  sulfate adenylyltransferase subunit 2  24.27 
 
 
317 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1618  sulfate adenylyltransferase subunit 2  34.29 
 
 
328 aa  43.5  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09980  sulfate adenylyltransferase subunit 2  24.09 
 
 
311 aa  43.5  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2430  sulfate adenylyltransferase subunit 2  46.15 
 
 
300 aa  42.7  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6191  hypothetical protein  25.11 
 
 
597 aa  42.7  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.450588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>