30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0688 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3022  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  99.75 
 
 		 406 aa  852    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00559  hypothetical protein  99.44 
 
 		 356 aa  748    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0408138  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0688  IbrA protein  100 
 
 		 406 aa  853    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0702  IbrA protein  82.06 
 
 		 411 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0644  IbrA protein  82.06 
 
 		 411 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0763  IbrA protein  82.8 
 
 		 411 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.216199  normal  0.291619 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0717  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  82.06 
 
 		 411 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0658  IbrA protein  82.06 
 
 		 411 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0623  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  98.03 
 
 		 406 aa  842    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3041  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  99.51 
 
 		 406 aa  849    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0623  IbrA protein  99.26 
 
 		 406 aa  848    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0654  IbrA protein  99.26 
 
 		 406 aa  847    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.533054  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00570  hypothetical protein  99.43 
 
 		 353 aa  742    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1125  immunoglobulin-binding regulator A-like protein  58.87 
 
 		 410 aa  519  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0856392 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3153  immunoglobulin-binding regulator A  57.78 
 
 		 408 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1385  IbrA  58.46 
 
 		 410 aa  513  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.576852 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1579  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  43.27 
 
 		 396 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3179  hypothetical protein  38.78 
 
 		 408 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37070  hypothetical protein  37.37 
 
 		 408 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02176  hypothetical protein  36.53 
 
 		 416 aa  236  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.219036 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0783  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.02 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1538  phosphoadenosine phosphosulfate sulfotransferase  28.81 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0166754  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3393  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.82 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5428  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.65 
 
 		 277 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.11 
 
 		 278 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0017648  normal  0.150799 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5808  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.11 
 
 		 278 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000032081 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  24.44 
 
 		 428 aa  47  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  24.54 
 
 		 796 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  22.28 
 
 		 428 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  23.27 
 
 		 428 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>