103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5620 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
278 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0017648  normal  0.150799 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5808  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
278 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000032081 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5428  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  70.59 
 
 
277 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3393  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.89 
 
 
273 aa  234  8e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  25.74 
 
 
428 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  25.97 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  23.38 
 
 
428 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  26.23 
 
 
428 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1789  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  36.45 
 
 
267 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000854791  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2800  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.86 
 
 
227 aa  58.9  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0240537  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  25.67 
 
 
441 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  25.81 
 
 
234 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  24.03 
 
 
592 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  26.94 
 
 
796 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  27.42 
 
 
469 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0604  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.25 
 
 
218 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.37 
 
 
268 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.572293  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03587  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.38 
 
 
248 aa  50.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.845085  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  25.66 
 
 
469 aa  49.7  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  44 
 
 
472 aa  49.3  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  26.27 
 
 
878 aa  49.3  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0654  IbrA protein  23.11 
 
 
406 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.533054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.68 
 
 
784 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1669  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.11 
 
 
241 aa  49.3  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.400633  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0623  IbrA protein  23.11 
 
 
406 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3041  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.11 
 
 
406 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0763  IbrA protein  24.02 
 
 
411 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.216199  normal  0.291619 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0688  IbrA protein  23.11 
 
 
406 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49112  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.44 
 
 
220 aa  49.3  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238936  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3022  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.11 
 
 
406 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1765  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.83 
 
 
226 aa  48.9  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  25.79 
 
 
634 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  25.31 
 
 
633 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  26.57 
 
 
880 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0812  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0623  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  22.69 
 
 
406 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.18 
 
 
885 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3992  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.93 
 
 
245 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1567  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.71 
 
 
224 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.779448  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4056  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  45.65 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.957521  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3551  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.97 
 
 
244 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3153  immunoglobulin-binding regulator A  27.31 
 
 
408 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0658  IbrA protein  23.58 
 
 
411 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0717  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  23.58 
 
 
411 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0702  IbrA protein  23.58 
 
 
411 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3128  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  47.92 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.377353 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2536  sulfate adenylyltransferase subunit 2  25.87 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.61 
 
 
723 aa  47.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3265  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.11 
 
 
258 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242292  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1077  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.98 
 
 
263 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1385  IbrA  27.27 
 
 
410 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.576852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.58 
 
 
246 aa  46.2  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.917723  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  23.89 
 
 
588 aa  45.8  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4016  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.56 
 
 
244 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.634763  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  25 
 
 
594 aa  45.8  0.0009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02607  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.56 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0926  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.05 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.518681  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1759  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.07 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2902  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.05 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3064  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.05 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.696985  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0950  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.05 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2890  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.05 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3113  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.05 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3157  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.22 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.267465 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0644  IbrA protein  21.88 
 
 
411 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02570  hypothetical protein  26.56 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02176  hypothetical protein  26.27 
 
 
416 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.219036 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  23.48 
 
 
503 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  24.88 
 
 
464 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  23.91 
 
 
512 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0404  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.25 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00412674  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002352  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  24.39 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000919211  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2328  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.95 
 
 
244 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000480323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2280  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.11 
 
 
244 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0503527  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41840  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.09 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  29.75 
 
 
614 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5165  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.78 
 
 
231 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  23.18 
 
 
594 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3442  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.95 
 
 
244 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0646773  hitchhiker  0.00239136 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00003  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  22.4 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1929  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.95 
 
 
244 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0556213  hitchhiker  0.0000000000165041 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3076  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.43 
 
 
244 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1717  sulfate adenylyltransferase subunit 2  26.49 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4761  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.6 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  24.67 
 
 
667 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3225  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.5 
 
 
244 aa  43.5  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1702  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.29 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0783  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.15 
 
 
431 aa  43.5  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3100  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.5 
 
 
244 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.337134  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4654  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  23.91 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.550549  hitchhiker  0.00181688 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3141  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.72 
 
 
244 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.682 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3258  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.72 
 
 
244 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3363  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.86 
 
 
244 aa  43.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1560  sulfate adenylyltransferase subunit 2  26.26 
 
 
293 aa  42.7  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.342351 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.5 
 
 
580 aa  42.7  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1757  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.73 
 
 
244 aa  42.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.81 
 
 
244 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.81 
 
 
244 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.480804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4543  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.38 
 
 
293 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.591012 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2560  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.66 
 
 
270 aa  42.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.786122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>