More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1717 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1717  sulfate adenylyltransferase subunit 2  100 
 
 		 267 aa  560  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1193  sulfate adenylyltransferase subunit 2  64.39 
 
 		 266 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3830  sulfate adenylyltransferase subunit 2  61.13 
 
 		 265 aa  355  5e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0104851  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6448  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60 
 
 		 286 aa  352  2.9999999999999997e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1630  sulfate adenylyltransferase subunit 2  58.65 
 
 		 268 aa  343  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000248691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2536  sulfate adenylyltransferase subunit 2  56.16 
 
 		 293 aa  328  6e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3063  sulfate adenylyltransferase subunit 2  59.47 
 
 		 264 aa  324  9e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4112  sulfate adenylyltransferase subunit 2  53.08 
 
 		 293 aa  315  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1399  sulfate adenylyltransferase subunit 2  53.96 
 
 		 264 aa  308  6.999999999999999e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2763  sulfate adenylyltransferase subunit 2  55.85 
 
 		 268 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6983  sulfate adenylyltransferase subunit 2  55.09 
 
 		 274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3563  sulfate adenylyltransferase subunit 2  55.09 
 
 		 268 aa  301  7.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4016  sulfate adenylyltransferase subunit 2  54.34 
 
 		 268 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.274422  normal  0.486671 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1560  sulfate adenylyltransferase subunit 2  51.71 
 
 		 293 aa  300  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.342351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1154  sulfate adenylyltransferase subunit 2  54.34 
 
 		 291 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1043  sulfate adenylyltransferase subunit 2  53.96 
 
 		 291 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0823  sulfate adenylyltransferase subunit 2  54.34 
 
 		 289 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168888  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3127  sulfate adenylyltransferase subunit 2  52.47 
 
 		 264 aa  290  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.360579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0828  sulfate adenylyltransferase subunit 2  48.47 
 
 		 312 aa  269  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0420  sulfate adenylyltransferase subunit 2  46.44 
 
 		 302 aa  268  8.999999999999999e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1261  sulfate adenylyltransferase subunit 2  48.81 
 
 		 315 aa  264  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2137  sulfate adenylyltransferase subunit 2  46.44 
 
 		 302 aa  263  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0796  sulfate adenylyltransferase subunit 2  46.44 
 
 		 302 aa  263  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2988  sulfate adenylyltransferase subunit 2  46.62 
 
 		 301 aa  262  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1422  sulfate adenylyltransferase subunit 2  46.62 
 
 		 301 aa  262  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  hitchhiker  0.00577944 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0663  sulfate adenylyltransferase subunit 2  46.1 
 
 		 302 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2142  sulfate adenylyltransferase subunit 2  46.44 
 
 		 299 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0113655  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2961  sulfate adenylyltransferase subunit 2  47.12 
 
 		 301 aa  260  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.889304 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2145  sulfate adenylyltransferase subunit 2  46.44 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1686  sulfate adenylyltransferase subunit 2  46.62 
 
 		 305 aa  260  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00766  sulfate adenylyltransferase subunit 2  46.44 
 
 		 302 aa  259  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2553  sulfate adenylyltransferase subunit 2  46.62 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001707  sulfate adenylyltransferase subunit 2  46.44 
 
 		 302 aa  259  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0157  sulfate adenylyltransferase subunit 2  45.42 
 
 		 303 aa  259  4e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0142128  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2344  sulfate adenylyltransferase subunit 2  47.12 
 
 		 302 aa  258  5.0000000000000005e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2891  sulfate adenylyltransferase subunit 2  45.61 
 
 		 302 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1686  sulfate adenylyltransferase subunit 2  46.44 
 
 		 301 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5015  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.48 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57720  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.48 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0063  sulfate adenylyltransferase subunit 2  45.61 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2182  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.9 
 
 		 301 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0959  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.07 
 
 		 302 aa  256  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.70821  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2970  sulfate adenylyltransferase subunit 2  45.89 
 
 		 293 aa  255  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2585  sulfate adenylyltransferase subunit 2  45.89 
 
 		 293 aa  255  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0831  sulfate adenylyltransferase subunit 2  45.08 
 
 		 302 aa  255  6e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4433  sulfate adenylate transferase, subunit 2  43.81 
 
 		 305 aa  254  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4128  sulfate adenylyltransferase subunit 2  43.81 
 
 		 305 aa  254  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0862  sulfate adenylyltransferase subunit 2  45.08 
 
 		 302 aa  254  7e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3072  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.75 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0900  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.75 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0863  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.75 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0997693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2629  sulfate adenylyltransferase subunit 2  45.08 
 
 		 302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3727  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.75 
 
 		 302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0928  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.75 
 
 		 302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3043  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.75 
 
 		 302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3408  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.75 
 
 		 302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0954  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.75 
 
 		 302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0962  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.75 
 
 		 302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02713  sulfate adenylyltransferase subunit 2  45.73 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1303  sulfate adenylyltransferase subunit 2  43.81 
 
 		 305 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1531  sulfate adenylyltransferase subunit 2  45.42 
 
 		 301 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6192  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.93 
 
 		 299 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4546  sulfate adenylyltransferase subunit 2  43.81 
 
 		 305 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4422  sulfate adenylyltransferase subunit 2  43.81 
 
 		 305 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0910  sulfate adenylyltransferase subunit 2  43.81 
 
 		 305 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0873034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3187  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.41 
 
 		 302 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3223  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.75 
 
 		 302 aa  252  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0818  sulfate adenylyltransferase subunit 2  45.08 
 
 		 302 aa  252  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.90537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0877  sulfate adenylyltransferase subunit 2  43.48 
 
 		 305 aa  251  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4559  sulfate adenylyltransferase subunit 2  45.24 
 
 		 299 aa  252  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1651  sulfate adenylyltransferase subunit 2  45.42 
 
 		 304 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3053  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.75 
 
 		 302 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305816  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02602  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.75 
 
 		 302 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0936  sulfate adenylyltransferase, small subunit  44.75 
 
 		 302 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2878  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.75 
 
 		 302 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02567  hypothetical protein  44.75 
 
 		 302 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0960  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.75 
 
 		 302 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4004  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.75 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1497  sulfate adenylyltransferase, small subunit  45.76 
 
 		 300 aa  250  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1299  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.59 
 
 		 303 aa  250  1e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.583086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1769  sulfate adenylyltransferase subunit 2  45.42 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000131984  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2624  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.26 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12970  sulfate adenylyltransferase subunit 2  43.14 
 
 		 305 aa  249  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2890  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.41 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1752  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.41 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2289  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.71 
 
 		 296 aa  248  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1750  sulfate adenylyltransferase subunit 2  45.42 
 
 		 328 aa  248  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0969  sulfate adenylyltransferase subunit 2  45.08 
 
 		 302 aa  248  6e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3304  sulfate adenylyltransferase subunit 2  45.08 
 
 		 302 aa  248  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3518  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.75 
 
 		 302 aa  248  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3361  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.75 
 
 		 302 aa  248  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2451  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.44 
 
 		 322 aa  248  6e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3436  sulfate adenylyltransferase subunit 2  45.08 
 
 		 302 aa  248  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494147  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2734  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.07 
 
 		 304 aa  248  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0448495  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6393  sulfate adenylyltransferase subunit 2  45.42 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.921257  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3122  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.07 
 
 		 302 aa  247  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1757  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.75 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2353  sulfate adenylyltransferase subunit 2  45.08 
 
 		 304 aa  246  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.295383  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0833  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.75 
 
 		 301 aa  245  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137161  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3086  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.07 
 
 		 302 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>