More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4016 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4016  sulfate adenylyltransferase subunit 2  100 
 
 		 268 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.274422  normal  0.486671 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2763  sulfate adenylyltransferase subunit 2  89.93 
 
 		 268 aa  499  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1154  sulfate adenylyltransferase subunit 2  92.42 
 
 		 291 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3563  sulfate adenylyltransferase subunit 2  88.81 
 
 		 268 aa  498  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0823  sulfate adenylyltransferase subunit 2  90.57 
 
 		 289 aa  493  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168888  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6983  sulfate adenylyltransferase subunit 2  89.51 
 
 		 274 aa  491  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1043  sulfate adenylyltransferase subunit 2  89.77 
 
 		 291 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1399  sulfate adenylyltransferase subunit 2  79.92 
 
 		 264 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3063  sulfate adenylyltransferase subunit 2  71.59 
 
 		 264 aa  414  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3127  sulfate adenylyltransferase subunit 2  68.18 
 
 		 264 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.360579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1193  sulfate adenylyltransferase subunit 2  54.51 
 
 		 266 aa  306  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1717  sulfate adenylyltransferase subunit 2  54.34 
 
 		 267 aa  300  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3830  sulfate adenylyltransferase subunit 2  53.56 
 
 		 265 aa  291  8e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0104851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1630  sulfate adenylyltransferase subunit 2  48.89 
 
 		 268 aa  275  7e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000248691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2536  sulfate adenylyltransferase subunit 2  47.44 
 
 		 293 aa  266  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4112  sulfate adenylyltransferase subunit 2  47.12 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6448  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  47.2 
 
 		 286 aa  263  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1560  sulfate adenylyltransferase subunit 2  44.41 
 
 		 293 aa  251  8.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.342351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4433  sulfate adenylate transferase, subunit 2  41.97 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4128  sulfate adenylyltransferase subunit 2  41.97 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5015  sulfate adenylyltransferase subunit 2  41.97 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57720  sulfate adenylyltransferase subunit 2  41.97 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0877  sulfate adenylyltransferase subunit 2  41.64 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1303  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.39 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2142  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.94 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0113655  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4546  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.39 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4422  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.39 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12970  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.98 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0910  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.39 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0873034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0770  sulfate adenylyltransferase subunit 2  41.69 
 
 		 317 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.183889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0881  sulfate adenylyltransferase subunit 2  41.69 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0890  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.66 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1531  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.94 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1750  sulfate adenylyltransferase subunit 2  41.08 
 
 		 328 aa  215  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2289  sulfate adenylyltransferase subunit 2  41.22 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0420  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.46 
 
 		 302 aa  214  9e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2182  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.6 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0157  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.67 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0142128  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6393  sulfate adenylyltransferase subunit 2  41.31 
 
 		 319 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.921257  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0796  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.39 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221596 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1422  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.87 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  hitchhiker  0.00577944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2891  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.13 
 
 		 302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2145  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.8 
 
 		 303 aa  212  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0558  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40 
 
 		 317 aa  211  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1527  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.86 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.596692 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0818  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.8 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.90537 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0831  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.47 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1120  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.66 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2961  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.2 
 
 		 301 aa  208  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.889304 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3727  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.8 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1752  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.46 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3072  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.8 
 
 		 302 aa  208  9e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0900  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.8 
 
 		 302 aa  208  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0863  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.8 
 
 		 302 aa  208  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0997693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4226  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.94 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0954723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1651  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.2 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0862  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.13 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1686  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.2 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0663  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.46 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02602  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.13 
 
 		 302 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0936  sulfate adenylyltransferase, small subunit  40.13 
 
 		 302 aa  206  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2878  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.13 
 
 		 302 aa  206  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1757  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.13 
 
 		 302 aa  206  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0828  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.85 
 
 		 312 aa  206  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0960  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.13 
 
 		 302 aa  206  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02567  hypothetical protein  40.13 
 
 		 302 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2137  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.13 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4004  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.13 
 
 		 302 aa  206  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1397  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.33 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.010369  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3043  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.13 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1779  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.72 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3053  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.13 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305816  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2585  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.59 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2970  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.59 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0328  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.72 
 
 		 322 aa  205  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1769  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.06 
 
 		 297 aa  205  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000131984  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0959  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.79 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.70821  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3361  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.39 
 
 		 302 aa  205  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3086  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.13 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0063  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.06 
 
 		 328 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3223  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.46 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1497  sulfate adenylyltransferase, small subunit  40 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2988  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.2 
 
 		 301 aa  205  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3141  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.13 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.431784 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3125  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.13 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.282658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1686  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.4 
 
 		 305 aa  205  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0954  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.79 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3408  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.79 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3060  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.13 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3245  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.13 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0962  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.79 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3518  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.39 
 
 		 302 aa  204  8e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0928  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.79 
 
 		 302 aa  204  8e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2890  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.8 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3304  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.8 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2553  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.4 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3436  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.8 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494147  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02134  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.2 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3187  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.46 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0969  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.8 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>