More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2878 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02602  sulfate adenylyltransferase subunit 2  100 
 
 
302 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0936  sulfate adenylyltransferase, small subunit  100 
 
 
302 aa  632  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4004  sulfate adenylyltransferase subunit 2  99.67 
 
 
302 aa  630  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02567  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2878  sulfate adenylyltransferase subunit 2  100 
 
 
302 aa  632  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0960  sulfate adenylyltransferase subunit 2  100 
 
 
302 aa  632  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3053  sulfate adenylyltransferase subunit 2  99.67 
 
 
302 aa  629  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305816  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2890  sulfate adenylyltransferase subunit 2  99.67 
 
 
302 aa  629  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3122  sulfate adenylyltransferase subunit 2  98.68 
 
 
302 aa  622  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3245  sulfate adenylyltransferase subunit 2  97.02 
 
 
302 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3141  sulfate adenylyltransferase subunit 2  97.02 
 
 
302 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.431784 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3125  sulfate adenylyltransferase subunit 2  97.02 
 
 
302 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.282658  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3060  sulfate adenylyltransferase subunit 2  97.02 
 
 
302 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3223  sulfate adenylyltransferase subunit 2  97.02 
 
 
302 aa  613  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3086  sulfate adenylyltransferase subunit 2  96.69 
 
 
302 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0831  sulfate adenylyltransferase subunit 2  95.03 
 
 
302 aa  603  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0862  sulfate adenylyltransferase subunit 2  94.7 
 
 
302 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3361  sulfate adenylyltransferase subunit 2  93.71 
 
 
302 aa  598  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3518  sulfate adenylyltransferase subunit 2  93.05 
 
 
302 aa  596  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0818  sulfate adenylyltransferase subunit 2  92.38 
 
 
302 aa  589  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.90537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3304  sulfate adenylyltransferase subunit 2  90.07 
 
 
302 aa  577  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3436  sulfate adenylyltransferase subunit 2  90.07 
 
 
302 aa  577  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0969  sulfate adenylyltransferase subunit 2  90.07 
 
 
302 aa  577  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0214  sulfate adenylyltransferase subunit 2  86.09 
 
 
302 aa  554  1e-157  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001707  sulfate adenylyltransferase subunit 2  83.77 
 
 
302 aa  543  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00766  sulfate adenylyltransferase subunit 2  83.44 
 
 
302 aa  541  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2137  sulfate adenylyltransferase subunit 2  81.46 
 
 
302 aa  525  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0420  sulfate adenylyltransferase subunit 2  80.79 
 
 
302 aa  527  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3727  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.45 
 
 
302 aa  497  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1422  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.04 
 
 
301 aa  500  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  hitchhiker  0.00577944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3072  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.45 
 
 
302 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0900  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.45 
 
 
302 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2961  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.44 
 
 
301 aa  498  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.889304 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0863  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.45 
 
 
302 aa  498  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0997693  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2891  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.79 
 
 
302 aa  500  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2624  sulfate adenylyltransferase subunit 2  79.05 
 
 
304 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2988  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.03 
 
 
301 aa  494  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2145  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.83 
 
 
303 aa  497  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0796  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.16 
 
 
302 aa  494  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221596 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0663  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.78 
 
 
302 aa  497  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2629  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.49 
 
 
302 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5015  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.81 
 
 
305 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3043  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.44 
 
 
302 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2344  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.15 
 
 
302 aa  492  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57720  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.81 
 
 
305 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12970  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.15 
 
 
305 aa  492  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2734  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.49 
 
 
304 aa  491  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0448495  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2142  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.92 
 
 
299 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0113655  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1686  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.69 
 
 
301 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3408  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.1 
 
 
302 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0928  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.1 
 
 
302 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0954  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.1 
 
 
302 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658343  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0962  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.44 
 
 
302 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1303  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.91 
 
 
305 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4422  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.91 
 
 
305 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.23638 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0157  sulfate adenylyltransferase subunit 2  74.83 
 
 
303 aa  486  1e-136  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0142128  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1686  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.52 
 
 
305 aa  486  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2553  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.18 
 
 
303 aa  485  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2182  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.5 
 
 
301 aa  487  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0910  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.91 
 
 
305 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0873034  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4546  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.91 
 
 
305 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4433  sulfate adenylate transferase, subunit 2  75.91 
 
 
305 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4128  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.91 
 
 
305 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0890  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.49 
 
 
305 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0877  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.58 
 
 
305 aa  481  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0959  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.08 
 
 
302 aa  481  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.70821  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1769  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.42 
 
 
297 aa  478  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000131984  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1651  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.09 
 
 
304 aa  480  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3187  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.76 
 
 
302 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02713  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.51 
 
 
294 aa  471  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2353  sulfate adenylyltransferase subunit 2  73.51 
 
 
304 aa  472  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.295383  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1261  sulfate adenylyltransferase subunit 2  74.66 
 
 
315 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115941  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1750  sulfate adenylyltransferase subunit 2  73.18 
 
 
328 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1397  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.08 
 
 
305 aa  467  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.010369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1531  sulfate adenylyltransferase subunit 2  72.24 
 
 
301 aa  462  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1497  sulfate adenylyltransferase, small subunit  72.97 
 
 
300 aa  463  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2859  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.43 
 
 
301 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0189476  hitchhiker  0.0000994971 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3934  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.76 
 
 
312 aa  454  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2353  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.17 
 
 
301 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633913  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3252  sulfate adenylyltransferase subunit 2  71.52 
 
 
304 aa  453  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1864  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.51 
 
 
301 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4226  sulfate adenylyltransferase subunit 2  71.14 
 
 
311 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0954723  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3341  sulfate adenylyltransferase subunit 2  71.52 
 
 
304 aa  448  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0833  sulfate adenylyltransferase subunit 2  71.72 
 
 
301 aa  447  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137161  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6393  sulfate adenylyltransferase subunit 2  70.47 
 
 
319 aa  443  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.921257  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1531  sulfate adenylyltransferase subunit 2  71.72 
 
 
298 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0063  sulfate adenylyltransferase subunit 2  70.61 
 
 
328 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0193  sulfate adenylyltransferase subunit 2  73.06 
 
 
300 aa  438  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552753  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0185  sulfate adenylyltransferase subunit 2  73.06 
 
 
300 aa  438  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00239646  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5495  sulfate adenylyltransferase subunit 2  71.38 
 
 
298 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437818  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0558  sulfate adenylyltransferase subunit 2  69.83 
 
 
317 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1527  sulfate adenylyltransferase subunit 2  71.48 
 
 
301 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.596692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1787  sulfate adenylyltransferase subunit 2  69.8 
 
 
319 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2233  sulfate adenylyltransferase subunit 2  69.67 
 
 
309 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.230531 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2509  sulfate adenylyltransferase subunit 2  69.67 
 
 
309 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1800  sulfate adenylyltransferase subunit 2  69.87 
 
 
312 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0200  sulfate adenylyltransferase subunit 2  72.39 
 
 
306 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0770  sulfate adenylyltransferase subunit 2  70.17 
 
 
317 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.183889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2191  sulfate adenylyltransferase subunit 2  70 
 
 
309 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1757  sulfate adenylyltransferase subunit 2  67.88 
 
 
302 aa  436  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>