More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1686 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1686  sulfate adenylyltransferase subunit 2  100 
 
 
301 aa  632  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2961  sulfate adenylyltransferase subunit 2  95.68 
 
 
301 aa  607  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.889304 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2988  sulfate adenylyltransferase subunit 2  94.02 
 
 
301 aa  600  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1422  sulfate adenylyltransferase subunit 2  93.02 
 
 
301 aa  588  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  hitchhiker  0.00577944 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0796  sulfate adenylyltransferase subunit 2  87.5 
 
 
302 aa  544  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2142  sulfate adenylyltransferase subunit 2  84.12 
 
 
299 aa  526  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0113655  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2145  sulfate adenylyltransferase subunit 2  82.43 
 
 
303 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0420  sulfate adenylyltransferase subunit 2  80.74 
 
 
302 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1651  sulfate adenylyltransferase subunit 2  82.43 
 
 
304 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02713  sulfate adenylyltransferase subunit 2  81.29 
 
 
294 aa  508  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2624  sulfate adenylyltransferase subunit 2  81.82 
 
 
304 aa  510  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0157  sulfate adenylyltransferase subunit 2  79.73 
 
 
303 aa  507  9.999999999999999e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0142128  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2891  sulfate adenylyltransferase subunit 2  80.41 
 
 
302 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00766  sulfate adenylyltransferase subunit 2  79.39 
 
 
302 aa  503  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2182  sulfate adenylyltransferase subunit 2  80.74 
 
 
301 aa  503  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2734  sulfate adenylyltransferase subunit 2  79.14 
 
 
304 aa  501  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0448495  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5015  sulfate adenylyltransferase subunit 2  79.4 
 
 
305 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0862  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.72 
 
 
302 aa  498  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0877  sulfate adenylyltransferase subunit 2  79.4 
 
 
305 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001707  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.72 
 
 
302 aa  500  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0831  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.38 
 
 
302 aa  500  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57720  sulfate adenylyltransferase subunit 2  79.4 
 
 
305 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2137  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.04 
 
 
302 aa  498  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3223  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.03 
 
 
302 aa  496  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12970  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.38 
 
 
305 aa  495  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1303  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.33 
 
 
305 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4546  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.33 
 
 
305 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4433  sulfate adenylate transferase, subunit 2  78.74 
 
 
305 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4128  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.74 
 
 
305 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0910  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.33 
 
 
305 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0873034  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4422  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.33 
 
 
305 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.23638 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02602  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.69 
 
 
302 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0936  sulfate adenylyltransferase, small subunit  76.69 
 
 
302 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3053  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.69 
 
 
302 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305816  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0960  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.69 
 
 
302 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2890  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.35 
 
 
302 aa  487  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2878  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.69 
 
 
302 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4004  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.35 
 
 
302 aa  488  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02567  hypothetical protein  76.69 
 
 
302 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3361  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.35 
 
 
302 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3518  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.69 
 
 
302 aa  488  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0663  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.69 
 
 
302 aa  489  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0818  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.35 
 
 
302 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.90537 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3086  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.35 
 
 
302 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3141  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.35 
 
 
302 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.431784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0890  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76 
 
 
305 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1686  sulfate adenylyltransferase subunit 2  79.12 
 
 
305 aa  485  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3060  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.35 
 
 
302 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3122  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.01 
 
 
302 aa  485  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3245  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.35 
 
 
302 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3125  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.35 
 
 
302 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.282658  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2629  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.49 
 
 
302 aa  483  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3727  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.01 
 
 
302 aa  483  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2553  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.79 
 
 
303 aa  483  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3072  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.01 
 
 
302 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0900  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.01 
 
 
302 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2344  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.69 
 
 
302 aa  482  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0863  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.01 
 
 
302 aa  483  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0997693  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2353  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.03 
 
 
304 aa  481  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.295383  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3436  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.34 
 
 
302 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494147  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0959  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.34 
 
 
302 aa  480  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.70821  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0969  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.34 
 
 
302 aa  478  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3304  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.34 
 
 
302 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3408  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75 
 
 
302 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3043  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75 
 
 
302 aa  476  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1769  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.68 
 
 
297 aa  475  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000131984  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1397  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.67 
 
 
305 aa  474  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.010369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0954  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75 
 
 
302 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658343  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0928  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75 
 
 
302 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0962  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75 
 
 
302 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0214  sulfate adenylyltransferase subunit 2  72.15 
 
 
302 aa  471  1e-132  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1531  sulfate adenylyltransferase subunit 2  72.76 
 
 
301 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3187  sulfate adenylyltransferase subunit 2  73.65 
 
 
302 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1497  sulfate adenylyltransferase, small subunit  72.73 
 
 
300 aa  461  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1531  sulfate adenylyltransferase subunit 2  74.66 
 
 
298 aa  457  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2859  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.08 
 
 
301 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0189476  hitchhiker  0.0000994971 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1261  sulfate adenylyltransferase subunit 2  72.64 
 
 
315 aa  460  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115941  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3934  sulfate adenylyltransferase subunit 2  74.42 
 
 
312 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1864  sulfate adenylyltransferase subunit 2  74.09 
 
 
301 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1750  sulfate adenylyltransferase subunit 2  71.62 
 
 
328 aa  449  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2353  sulfate adenylyltransferase subunit 2  74.09 
 
 
301 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633913  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4226  sulfate adenylyltransferase subunit 2  70.95 
 
 
311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0954723  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5495  sulfate adenylyltransferase subunit 2  71.96 
 
 
298 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437818  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0328  sulfate adenylyltransferase subunit 2  71.19 
 
 
322 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0833  sulfate adenylyltransferase subunit 2  70.76 
 
 
301 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137161  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6393  sulfate adenylyltransferase subunit 2  71.28 
 
 
319 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.921257  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0063  sulfate adenylyltransferase subunit 2  70.61 
 
 
328 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1757  sulfate adenylyltransferase subunit 2  68.77 
 
 
302 aa  442  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2289  sulfate adenylyltransferase subunit 2  70.17 
 
 
296 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1120  sulfate adenylyltransferase subunit 2  67.12 
 
 
316 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1752  sulfate adenylyltransferase subunit 2  68.44 
 
 
302 aa  438  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1787  sulfate adenylyltransferase subunit 2  69.59 
 
 
319 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0770  sulfate adenylyltransferase subunit 2  69.49 
 
 
317 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.183889 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3252  sulfate adenylyltransferase subunit 2  69.36 
 
 
304 aa  435  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3341  sulfate adenylyltransferase subunit 2  70.03 
 
 
304 aa  435  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0558  sulfate adenylyltransferase subunit 2  68.81 
 
 
317 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02134  sulfate adenylyltransferase subunit 2  67.91 
 
 
302 aa  431  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4559  sulfate adenylyltransferase subunit 2  68.14 
 
 
299 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5480  sulfate adenylyltransferase subunit 2  68.67 
 
 
311 aa  431  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0232968  decreased coverage  0.0059781 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6192  sulfate adenylyltransferase subunit 2  68.14 
 
 
299 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>