More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2988 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2988  sulfate adenylyltransferase subunit 2  100 
 
 		 301 aa  630  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2961  sulfate adenylyltransferase subunit 2  95.68 
 
 		 301 aa  607  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.889304 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1686  sulfate adenylyltransferase subunit 2  94.02 
 
 		 301 aa  600  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1422  sulfate adenylyltransferase subunit 2  92.69 
 
 		 301 aa  588  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  hitchhiker  0.00577944 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0796  sulfate adenylyltransferase subunit 2  88.85 
 
 		 302 aa  553  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2142  sulfate adenylyltransferase subunit 2  85.14 
 
 		 299 aa  529  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0113655  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2145  sulfate adenylyltransferase subunit 2  84.12 
 
 		 303 aa  526  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0420  sulfate adenylyltransferase subunit 2  81 
 
 		 302 aa  526  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02713  sulfate adenylyltransferase subunit 2  83.33 
 
 		 294 aa  518  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1651  sulfate adenylyltransferase subunit 2  82.77 
 
 		 304 aa  518  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2891  sulfate adenylyltransferase subunit 2  81.42 
 
 		 302 aa  512  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2624  sulfate adenylyltransferase subunit 2  81.82 
 
 		 304 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2734  sulfate adenylyltransferase subunit 2  80.79 
 
 		 304 aa  511  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0448495  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2182  sulfate adenylyltransferase subunit 2  81.42 
 
 		 301 aa  508  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0831  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.26 
 
 		 302 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0157  sulfate adenylyltransferase subunit 2  79 
 
 		 303 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0142128  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2137  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.72 
 
 		 302 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5015  sulfate adenylyltransferase subunit 2  79.67 
 
 		 305 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57720  sulfate adenylyltransferase subunit 2  79.67 
 
 		 305 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0862  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.6 
 
 		 302 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12970  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.7 
 
 		 305 aa  501  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00766  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.72 
 
 		 302 aa  503  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001707  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.38 
 
 		 302 aa  502  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1303  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.33 
 
 		 305 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4433  sulfate adenylate transferase, subunit 2  78.33 
 
 		 305 aa  497  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4128  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.33 
 
 		 305 aa  497  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4422  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.33 
 
 		 305 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3223  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.92 
 
 		 302 aa  500  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0910  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.33 
 
 		 305 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0873034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4546  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.33 
 
 		 305 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02602  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.03 
 
 		 302 aa  494  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2878  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.03 
 
 		 302 aa  494  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0936  sulfate adenylyltransferase, small subunit  77.03 
 
 		 302 aa  494  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3518  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.92 
 
 		 302 aa  495  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0877  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.33 
 
 		 305 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0960  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.03 
 
 		 302 aa  494  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3361  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.59 
 
 		 302 aa  495  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0663  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76 
 
 		 302 aa  494  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3053  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.59 
 
 		 302 aa  495  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305816  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02567  hypothetical protein  77.03 
 
 		 302 aa  494  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3727  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.03 
 
 		 302 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2890  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.69 
 
 		 302 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3086  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.25 
 
 		 302 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1686  sulfate adenylyltransferase subunit 2  79.46 
 
 		 305 aa  491  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3060  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.25 
 
 		 302 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3122  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.92 
 
 		 302 aa  491  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3072  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.03 
 
 		 302 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0900  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.03 
 
 		 302 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3245  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.25 
 
 		 302 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0863  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.03 
 
 		 302 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0997693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3141  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.25 
 
 		 302 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.431784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0818  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.25 
 
 		 302 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.90537 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4004  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.69 
 
 		 302 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2353  sulfate adenylyltransferase subunit 2  78.04 
 
 		 304 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.295383  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3125  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.25 
 
 		 302 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.282658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0890  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77 
 
 		 305 aa  488  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0959  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.69 
 
 		 302 aa  489  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.70821  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2553  sulfate adenylyltransferase subunit 2  79.12 
 
 		 303 aa  490  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2344  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.7 
 
 		 302 aa  490  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2629  sulfate adenylyltransferase subunit 2  77.7 
 
 		 302 aa  485  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3043  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.68 
 
 		 302 aa  485  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1769  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.35 
 
 		 297 aa  484  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000131984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0928  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.68 
 
 		 302 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0954  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.68 
 
 		 302 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0962  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.68 
 
 		 302 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3408  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.68 
 
 		 302 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0969  sulfate adenylyltransferase subunit 2  74.92 
 
 		 302 aa  480  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3436  sulfate adenylyltransferase subunit 2  74.92 
 
 		 302 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494147  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3304  sulfate adenylyltransferase subunit 2  74.92 
 
 		 302 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1397  sulfate adenylyltransferase subunit 2  76.35 
 
 		 305 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.010369  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0214  sulfate adenylyltransferase subunit 2  72.24 
 
 		 302 aa  475  1e-133  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3187  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.68 
 
 		 302 aa  477  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1531  sulfate adenylyltransferase subunit 2  72.64 
 
 		 301 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1261  sulfate adenylyltransferase subunit 2  73.31 
 
 		 315 aa  467  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1497  sulfate adenylyltransferase, small subunit  73.06 
 
 		 300 aa  463  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2859  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.42 
 
 		 301 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0189476  hitchhiker  0.0000994971 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2353  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.42 
 
 		 301 aa  457  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633913  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1864  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.08 
 
 		 301 aa  457  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3934  sulfate adenylyltransferase subunit 2  74.42 
 
 		 312 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6393  sulfate adenylyltransferase subunit 2  72.64 
 
 		 319 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.921257  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1750  sulfate adenylyltransferase subunit 2  71.62 
 
 		 328 aa  455  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1531  sulfate adenylyltransferase subunit 2  72.64 
 
 		 298 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5495  sulfate adenylyltransferase subunit 2  71.96 
 
 		 298 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1757  sulfate adenylyltransferase subunit 2  71.62 
 
 		 302 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4226  sulfate adenylyltransferase subunit 2  70.95 
 
 		 311 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0954723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1752  sulfate adenylyltransferase subunit 2  70.95 
 
 		 302 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1787  sulfate adenylyltransferase subunit 2  70.27 
 
 		 319 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0063  sulfate adenylyltransferase subunit 2  69.93 
 
 		 328 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0833  sulfate adenylyltransferase subunit 2  70.76 
 
 		 301 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137161  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0328  sulfate adenylyltransferase subunit 2  69.49 
 
 		 322 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2289  sulfate adenylyltransferase subunit 2  70.51 
 
 		 296 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3252  sulfate adenylyltransferase subunit 2  69.7 
 
 		 304 aa  443  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6192  sulfate adenylyltransferase subunit 2  69.15 
 
 		 299 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4559  sulfate adenylyltransferase subunit 2  69.15 
 
 		 299 aa  441  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1120  sulfate adenylyltransferase subunit 2  67.8 
 
 		 316 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5480  sulfate adenylyltransferase subunit 2  70.27 
 
 		 311 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0232968  decreased coverage  0.0059781 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1527  sulfate adenylyltransferase subunit 2  69.54 
 
 		 301 aa  437  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.596692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2233  sulfate adenylyltransferase subunit 2  69.93 
 
 		 309 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.230531 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2509  sulfate adenylyltransferase subunit 2  69.93 
 
 		 309 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3341  sulfate adenylyltransferase subunit 2  69.33 
 
 		 304 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>