More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1630 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1630  sulfate adenylyltransferase subunit 2  100 
 
 		 268 aa  563  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000248691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1717  sulfate adenylyltransferase subunit 2  58.65 
 
 		 267 aa  343  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1193  sulfate adenylyltransferase subunit 2  57.46 
 
 		 266 aa  342  4e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3830  sulfate adenylyltransferase subunit 2  50.93 
 
 		 265 aa  301  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0104851  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6448  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.26 
 
 		 286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3127  sulfate adenylyltransferase subunit 2  50 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.360579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4016  sulfate adenylyltransferase subunit 2  48.89 
 
 		 268 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.274422  normal  0.486671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0823  sulfate adenylyltransferase subunit 2  50 
 
 		 289 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168888  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2763  sulfate adenylyltransferase subunit 2  49.26 
 
 		 268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1399  sulfate adenylyltransferase subunit 2  49.26 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3063  sulfate adenylyltransferase subunit 2  49.26 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4112  sulfate adenylyltransferase subunit 2  47.28 
 
 		 293 aa  272  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6983  sulfate adenylyltransferase subunit 2  48.89 
 
 		 274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2536  sulfate adenylyltransferase subunit 2  47.28 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1043  sulfate adenylyltransferase subunit 2  48.15 
 
 		 291 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1154  sulfate adenylyltransferase subunit 2  47.78 
 
 		 291 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3563  sulfate adenylyltransferase subunit 2  47.41 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1560  sulfate adenylyltransferase subunit 2  43.2 
 
 		 293 aa  260  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.342351 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3187  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.74 
 
 		 302 aa  226  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12970  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.53 
 
 		 305 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0818  sulfate adenylyltransferase subunit 2  41.75 
 
 		 302 aa  225  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.90537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2182  sulfate adenylyltransferase subunit 2  41.22 
 
 		 301 aa  224  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57720  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.2 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5015  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.2 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0831  sulfate adenylyltransferase subunit 2  41.41 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0959  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.4 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.70821  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1303  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.2 
 
 		 305 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4422  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.2 
 
 		 305 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4546  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.2 
 
 		 305 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2145  sulfate adenylyltransferase subunit 2  41.75 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0910  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.2 
 
 		 305 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0873034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2344  sulfate adenylyltransferase subunit 2  41.41 
 
 		 302 aa  222  6e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1120  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40 
 
 		 316 aa  221  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0890  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.87 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0420  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.4 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0828  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.74 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0962  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.4 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0954  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.4 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3408  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.4 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3043  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.4 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0928  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.4 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0862  sulfate adenylyltransferase subunit 2  41.08 
 
 		 302 aa  219  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3223  sulfate adenylyltransferase subunit 2  41 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2988  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.68 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2142  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.07 
 
 		 299 aa  218  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0113655  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4433  sulfate adenylate transferase, subunit 2  39.2 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4128  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.2 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3072  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.73 
 
 		 302 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0900  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.73 
 
 		 302 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0863  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.73 
 
 		 302 aa  219  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0997693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1752  sulfate adenylyltransferase subunit 2  41.41 
 
 		 302 aa  218  6e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2509  sulfate adenylyltransferase subunit 2  42.09 
 
 		 309 aa  218  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1261  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.68 
 
 		 315 aa  218  6e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2233  sulfate adenylyltransferase subunit 2  42.09 
 
 		 309 aa  218  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.230531 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1686  sulfate adenylyltransferase subunit 2  41.02 
 
 		 305 aa  218  8.999999999999998e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2191  sulfate adenylyltransferase subunit 2  42.09 
 
 		 309 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00766  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.07 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5480  sulfate adenylyltransferase subunit 2  41.75 
 
 		 311 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0232968  decreased coverage  0.0059781 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001707  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.07 
 
 		 302 aa  217  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0558  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.6 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0063  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40 
 
 		 328 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1422  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.68 
 
 		 301 aa  216  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  hitchhiker  0.00577944 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2137  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.39 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3727  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.39 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0877  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.87 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3361  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.74 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3518  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.74 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0157  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.33 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0142128  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2553  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.68 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3304  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.74 
 
 		 302 aa  215  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0969  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.74 
 
 		 302 aa  215  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6192  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.34 
 
 		 299 aa  215  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0796  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.39 
 
 		 302 aa  216  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221596 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3436  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.74 
 
 		 302 aa  215  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494147  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2961  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.4 
 
 		 301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.889304 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4559  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.34 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0770  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40 
 
 		 317 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.183889 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2891  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.07 
 
 		 302 aa  215  8e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02602  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.4 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0936  sulfate adenylyltransferase, small subunit  40.4 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1757  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.74 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3053  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.4 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305816  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02567  hypothetical protein  40.4 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0833  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.4 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137161  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4004  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.4 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0960  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.4 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2624  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0881  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2878  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.4 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0663  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.39 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1686  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.34 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1800  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.4 
 
 		 312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2890  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.07 
 
 		 302 aa  211  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0328  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40 
 
 		 322 aa  211  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02713  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.82 
 
 		 294 aa  211  7.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3122  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.73 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0071  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.98 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0214  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.66 
 
 		 302 aa  209  3e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1497  sulfate adenylyltransferase, small subunit  39.53 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2353  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.93 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.295383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>