More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6448 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6448  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
286 aa  600  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168639  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2536  sulfate adenylyltransferase subunit 2  67.24 
 
 
293 aa  407  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4112  sulfate adenylyltransferase subunit 2  66.21 
 
 
293 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3830  sulfate adenylyltransferase subunit 2  64.69 
 
 
265 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0104851  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1560  sulfate adenylyltransferase subunit 2  64.16 
 
 
293 aa  385  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.342351 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1193  sulfate adenylyltransferase subunit 2  56.99 
 
 
266 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1717  sulfate adenylyltransferase subunit 2  60 
 
 
267 aa  352  2.9999999999999997e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1630  sulfate adenylyltransferase subunit 2  48.26 
 
 
268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000248691  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3063  sulfate adenylyltransferase subunit 2  49.3 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6983  sulfate adenylyltransferase subunit 2  48.6 
 
 
274 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2763  sulfate adenylyltransferase subunit 2  48.6 
 
 
268 aa  269  5e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3127  sulfate adenylyltransferase subunit 2  47.9 
 
 
264 aa  266  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.360579  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3563  sulfate adenylyltransferase subunit 2  47.9 
 
 
268 aa  265  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1043  sulfate adenylyltransferase subunit 2  48.6 
 
 
291 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582671  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4016  sulfate adenylyltransferase subunit 2  47.2 
 
 
268 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.274422  normal  0.486671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1154  sulfate adenylyltransferase subunit 2  48.25 
 
 
291 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1399  sulfate adenylyltransferase subunit 2  46.85 
 
 
264 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0823  sulfate adenylyltransferase subunit 2  47.9 
 
 
289 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168888  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0828  sulfate adenylyltransferase subunit 2  41.59 
 
 
312 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0071  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.22 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1299  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.66 
 
 
303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.583086  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2891  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.92 
 
 
302 aa  211  9e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0558  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.17 
 
 
317 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1120  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.17 
 
 
316 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0157  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.29 
 
 
303 aa  209  4e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0142128  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2182  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.41 
 
 
301 aa  208  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1318  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.68 
 
 
308 aa  208  9e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.237649  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2451  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.73 
 
 
322 aa  208  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2137  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.66 
 
 
302 aa  206  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1497  sulfate adenylyltransferase, small subunit  37.78 
 
 
300 aa  206  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0328  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.92 
 
 
322 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2289  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.73 
 
 
296 aa  205  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1261  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.73 
 
 
315 aa  205  7e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115941  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1531  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.34 
 
 
301 aa  205  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1017  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.1 
 
 
300 aa  205  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.705101 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2142  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.34 
 
 
299 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0113655  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2145  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.29 
 
 
303 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1686  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.41 
 
 
305 aa  203  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1779  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.74 
 
 
302 aa  202  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1769  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.34 
 
 
297 aa  202  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000131984  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0420  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.91 
 
 
302 aa  202  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1757  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.03 
 
 
302 aa  202  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2553  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.41 
 
 
303 aa  202  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1752  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.39 
 
 
302 aa  202  5e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2629  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.34 
 
 
302 aa  202  6e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2344  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.34 
 
 
302 aa  201  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0831  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.29 
 
 
302 aa  201  9e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5015  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.5 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57720  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.5 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0796  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.03 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0770  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.26 
 
 
317 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.183889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4433  sulfate adenylate transferase, subunit 2  37.19 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4128  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.19 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0214  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.08 
 
 
302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2624  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.22 
 
 
304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1303  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.88 
 
 
305 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4546  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.88 
 
 
305 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4422  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.88 
 
 
305 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.23638 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3043  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.34 
 
 
302 aa  199  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0954  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.34 
 
 
302 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658343  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0928  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.34 
 
 
302 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001707  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.34 
 
 
302 aa  199  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12970  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.19 
 
 
305 aa  199  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3408  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.34 
 
 
302 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0962  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.34 
 
 
302 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00766  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.34 
 
 
302 aa  198  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0881  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.26 
 
 
317 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2734  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.03 
 
 
304 aa  198  9e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0448495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0910  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.88 
 
 
305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0873034  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9630  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.66 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749567  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0862  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.66 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2353  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.39 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.295383  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1422  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.26 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  hitchhiker  0.00577944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3072  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.71 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0900  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.71 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0863  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.71 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0997693  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0959  sulfate adenylyltransferase subunit 2  35.44 
 
 
302 aa  196  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.70821  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0663  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.71 
 
 
302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3727  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.08 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0877  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.56 
 
 
305 aa  195  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4559  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.39 
 
 
299 aa  195  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1527  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.61 
 
 
301 aa  195  6e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.596692 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0818  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.03 
 
 
302 aa  195  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.90537 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6192  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.62 
 
 
299 aa  195  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2585  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.18 
 
 
293 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2970  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.18 
 
 
293 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0890  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.25 
 
 
305 aa  195  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0833  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.39 
 
 
301 aa  195  9e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137161  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0063  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.58 
 
 
328 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3187  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.39 
 
 
302 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1618  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.1 
 
 
328 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3223  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.39 
 
 
302 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6393  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.97 
 
 
319 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.921257  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4004  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.46 
 
 
302 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1651  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.19 
 
 
304 aa  193  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1750  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.71 
 
 
328 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0063  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.58 
 
 
301 aa  193  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02713  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.42 
 
 
294 aa  193  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3304  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.39 
 
 
302 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0969  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.39 
 
 
302 aa  192  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>