23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00559 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3022  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  99.72 
 
 
406 aa  749    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00559  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  748    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0408138  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0688  IbrA protein  99.44 
 
 
406 aa  748    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49112  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0702  IbrA protein  82.35 
 
 
411 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0644  IbrA protein  82.35 
 
 
411 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0654  IbrA protein  99.72 
 
 
406 aa  748    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.533054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0623  IbrA protein  99.72 
 
 
406 aa  750    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3041  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
406 aa  751    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0623  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  98.6 
 
 
406 aa  744    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0763  IbrA protein  83.19 
 
 
411 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.216199  normal  0.291619 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00570  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  743    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0717  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  82.35 
 
 
411 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0658  IbrA protein  82.35 
 
 
411 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3153  immunoglobulin-binding regulator A  59.83 
 
 
408 aa  471  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1125  immunoglobulin-binding regulator A-like protein  60.11 
 
 
410 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0856392 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1385  IbrA  58.99 
 
 
410 aa  463  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.576852 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1579  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  43.64 
 
 
396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3179  hypothetical protein  38.11 
 
 
408 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37070  hypothetical protein  36.93 
 
 
408 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02176  hypothetical protein  35.26 
 
 
416 aa  196  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.219036 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0783  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.08 
 
 
431 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1538  phosphoadenosine phosphosulfate sulfotransferase  28.27 
 
 
440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0166754  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3393  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.52 
 
 
273 aa  47.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>