More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3113 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2931  GMP synthase  97.5 
 
 		 521 aa  1043    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.114397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  100 
 
 		 521 aa  1063    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  74.17 
 
 		 530 aa  792    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  74.85 
 
 		 520 aa  809    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3156  GMP synthase  96.93 
 
 		 521 aa  1039    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0345833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  87.04 
 
 		 518 aa  929    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  75.82 
 
 		 520 aa  817    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  74.85 
 
 		 520 aa  811    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3211  GMP synthase  71.46 
 
 		 541 aa  773    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  79.96 
 
 		 534 aa  852    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  60.65 
 
 		 516 aa  634    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  70.27 
 
 		 520 aa  754    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  76.21 
 
 		 535 aa  822    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  75.63 
 
 		 523 aa  814    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0005  GMP synthase  71.81 
 
 		 518 aa  758    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  90.52 
 
 		 518 aa  976    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1867  GMP synthase  72.01 
 
 		 518 aa  758    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  60.27 
 
 		 516 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  87.43 
 
 		 518 aa  933    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  74.08 
 
 		 520 aa  809    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  77.04 
 
 		 565 aa  833    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  72.2 
 
 		 525 aa  769    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0378  GMP synthase, large subunit  76.78 
 
 		 534 aa  809    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3189  GMP synthase  75.88 
 
 		 540 aa  806    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  72.94 
 
 		 540 aa  791    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1635  GMP synthase  71.81 
 
 		 518 aa  757    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.90601  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2221  GMP synthase  69.79 
 
 		 535 aa  733    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  77.82 
 
 		 535 aa  830    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  74.27 
 
 		 520 aa  813    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  77.24 
 
 		 556 aa  828    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  75.05 
 
 		 540 aa  813    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  74.85 
 
 		 520 aa  810    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1375  GMP synthase  70.16 
 
 		 520 aa  740    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0634  GMP synthase  72.2 
 
 		 537 aa  773    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.324774 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  60.65 
 
 		 517 aa  643    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  72.25 
 
 		 518 aa  786    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  74.28 
 
 		 519 aa  796    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2895  GMP synthase, large subunit  73.42 
 
 		 533 aa  787    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.131714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  75.1 
 
 		 526 aa  806    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  77.12 
 
 		 524 aa  840    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  70.52 
 
 		 528 aa  743    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  72.78 
 
 		 519 aa  786    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3696  GMP synthase  73.08 
 
 		 519 aa  780    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  60.08 
 
 		 518 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1587  GMP synthase  70.74 
 
 		 520 aa  741    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0923509 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  60.65 
 
 		 516 aa  636    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  60.89 
 
 		 514 aa  631  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  60.89 
 
 		 514 aa  631  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  58.08 
 
 		 525 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  58.08 
 
 		 525 aa  619  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  58.08 
 
 		 525 aa  619  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  58.08 
 
 		 525 aa  619  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  58.08 
 
 		 525 aa  619  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  58.08 
 
 		 525 aa  619  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  58.08 
 
 		 525 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  58.08 
 
 		 525 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  58.08 
 
 		 525 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  58.08 
 
 		 525 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  58.08 
 
 		 525 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  57.69 
 
 		 525 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  57.88 
 
 		 525 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  60.69 
 
 		 518 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  57.69 
 
 		 525 aa  617  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  60.69 
 
 		 518 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  61.27 
 
 		 518 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  57.5 
 
 		 525 aa  613  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  57.09 
 
 		 517 aa  609  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  58.17 
 
 		 511 aa  611  1e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  60.12 
 
 		 521 aa  608  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  57.28 
 
 		 517 aa  608  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  58.29 
 
 		 526 aa  608  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  59.73 
 
 		 518 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  58.05 
 
 		 520 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  59.24 
 
 		 522 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  56.5 
 
 		 517 aa  608  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  58.38 
 
 		 520 aa  605  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  58.72 
 
 		 520 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  56.92 
 
 		 525 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  58.82 
 
 		 527 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2547  GMP synthase  58.78 
 
 		 538 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72593  hitchhiker  0.00733595 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  55.77 
 
 		 525 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3013  GMP synthase  58.52 
 
 		 540 aa  604  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1261  GMP synthase  58.96 
 
 		 538 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2063  GMP synthase, large subunit  59.02 
 
 		 532 aa  603  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0340406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  56.54 
 
 		 525 aa  601  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  56.35 
 
 		 525 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.7 
 
 		 517 aa  604  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1269  GMP synthase  56.15 
 
 		 525 aa  599  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0189098  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  55.66 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  55.66 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  55.66 
 
 		 525 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  55.66 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  57.61 
 
 		 522 aa  601  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2058  GMP synthase  58.92 
 
 		 599 aa  598  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  58.82 
 
 		 527 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  56.24 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  56.26 
 
 		 523 aa  600  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1138  GMP synthase  55.85 
 
 		 525 aa  599  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.045866  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  56.24 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  55.09 
 
 		 525 aa  598  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>