More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2269 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  77.24 
 
 		 521 aa  830    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  74.66 
 
 		 520 aa  826    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1867  GMP synthase  70.41 
 
 		 518 aa  737    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  72.53 
 
 		 520 aa  806    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0378  GMP synthase, large subunit  75.24 
 
 		 534 aa  810    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246609 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  63.57 
 
 		 516 aa  664    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  70.76 
 
 		 520 aa  754    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  61.75 
 
 		 514 aa  644    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  73.88 
 
 		 520 aa  820    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  61.75 
 
 		 514 aa  644    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  62.02 
 
 		 517 aa  662    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  77.25 
 
 		 524 aa  835    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  88.33 
 
 		 535 aa  949    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  72.71 
 
 		 520 aa  814    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  72.78 
 
 		 530 aa  800    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  73.11 
 
 		 526 aa  795    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0005  GMP synthase  70.02 
 
 		 518 aa  734    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  71.98 
 
 		 528 aa  753    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  72.53 
 
 		 520 aa  807    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1587  GMP synthase  69.38 
 
 		 520 aa  741    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0923509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  72.04 
 
 		 525 aa  768    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  70.57 
 
 		 518 aa  781    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3189  GMP synthase  92.96 
 
 		 540 aa  1009    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  73.68 
 
 		 540 aa  792    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2221  GMP synthase  67.5 
 
 		 535 aa  706    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1635  GMP synthase  70.02 
 
 		 518 aa  734    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.90601  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  73.68 
 
 		 523 aa  812    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  90.28 
 
 		 535 aa  1004    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  92.31 
 
 		 565 aa  1040    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  100 
 
 		 556 aa  1130    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  86.67 
 
 		 540 aa  976    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3696  GMP synthase  69.5 
 
 		 519 aa  746    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3156  GMP synthase  76.85 
 
 		 521 aa  823    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0345833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2931  GMP synthase  76.85 
 
 		 521 aa  823    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.114397 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1375  GMP synthase  67.64 
 
 		 520 aa  719    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0634  GMP synthase  71.86 
 
 		 537 aa  784    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.324774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  76.41 
 
 		 519 aa  835    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  61.82 
 
 		 516 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  78.4 
 
 		 518 aa  839    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  78.76 
 
 		 518 aa  837    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  70.68 
 
 		 519 aa  758    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  80.75 
 
 		 534 aa  899    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3211  GMP synthase  67.1 
 
 		 541 aa  751    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  79.73 
 
 		 518 aa  850    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2895  GMP synthase, large subunit  71.56 
 
 		 533 aa  791    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.131714 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  63.57 
 
 		 516 aa  664    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  72.9 
 
 		 520 aa  818    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  61.15 
 
 		 518 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  60.58 
 
 		 518 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  60.23 
 
 		 518 aa  625  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  60.96 
 
 		 518 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  60.96 
 
 		 518 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  59.96 
 
 		 515 aa  618  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  59.57 
 
 		 515 aa  616  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  59.22 
 
 		 515 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  57.89 
 
 		 514 aa  613  9.999999999999999e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  58.37 
 
 		 522 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  59.03 
 
 		 512 aa  609  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  58.77 
 
 		 521 aa  608  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  57.67 
 
 		 511 aa  605  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  56.93 
 
 		 527 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2547  GMP synthase  58.29 
 
 		 538 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72593  hitchhiker  0.00733595 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  56.35 
 
 		 522 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  57.86 
 
 		 512 aa  603  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1261  GMP synthase  58.29 
 
 		 538 aa  600  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1287  GMP synthase  57.51 
 
 		 539 aa  597  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0197854  normal  0.456639 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2063  GMP synthase, large subunit  58.38 
 
 		 532 aa  596  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0340406 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  56.92 
 
 		 520 aa  597  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  57.28 
 
 		 515 aa  597  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  56.93 
 
 		 527 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  56.46 
 
 		 526 aa  595  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  57.12 
 
 		 527 aa  598  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  57.62 
 
 		 511 aa  597  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  56.09 
 
 		 513 aa  593  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2058  GMP synthase  57.12 
 
 		 599 aa  592  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2021  GMP synthase  57.14 
 
 		 539 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637137  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1522  GMP synthase  57.14 
 
 		 539 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.403543  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  58.17 
 
 		 512 aa  589  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  55.81 
 
 		 525 aa  590  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2337  GMP synthase  55.9 
 
 		 544 aa  588  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2546  GMP synthase  57.12 
 
 		 547 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222873  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3290  GMP synthase  57.14 
 
 		 539 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0624455  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  58.41 
 
 		 520 aa  588  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1292  GMP synthase  57.14 
 
 		 539 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2454  GMP synthase  57.14 
 
 		 539 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.62 
 
 		 517 aa  590  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2402  GMP synthase  57.14 
 
 		 539 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.630699  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  55.09 
 
 		 525 aa  585  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3367  GMP synthase  56.77 
 
 		 541 aa  586  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1431  GMP synthase  56.4 
 
 		 547 aa  586  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00571837  normal  0.0960661 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  55.09 
 
 		 525 aa  585  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  55.09 
 
 		 525 aa  585  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  56.31 
 
 		 516 aa  588  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  56.31 
 
 		 516 aa  586  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  55.21 
 
 		 523 aa  586  1e-166  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  55.09 
 
 		 525 aa  585  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2009  GMP synthase  57.33 
 
 		 539 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  55.28 
 
 		 525 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1989  GMP synthase  57.33 
 
 		 539 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314253  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.67 
 
 		 510 aa  585  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>