More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3125 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  71.84 
 
 		 515 aa  790    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  61.37 
 
 		 517 aa  656    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  61.37 
 
 		 516 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  62.16 
 
 		 516 aa  656    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  61.96 
 
 		 516 aa  655    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  80.23 
 
 		 516 aa  860    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  93.2 
 
 		 515 aa  991    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  100 
 
 		 515 aa  1052    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  59.02 
 
 		 514 aa  652    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  61.67 
 
 		 518 aa  653    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  72.04 
 
 		 515 aa  771    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  80.82 
 
 		 511 aa  869    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  60.12 
 
 		 518 aa  628  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  59.73 
 
 		 518 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  59.14 
 
 		 518 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  58.15 
 
 		 516 aa  618  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  58.95 
 
 		 518 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  59.57 
 
 		 556 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  58.54 
 
 		 522 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  59.14 
 
 		 511 aa  614  9.999999999999999e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  56.86 
 
 		 509 aa  610  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  57.86 
 
 		 535 aa  608  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  57.37 
 
 		 512 aa  608  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  59.03 
 
 		 535 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  59.69 
 
 		 519 aa  608  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  58.79 
 
 		 528 aa  604  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  58.83 
 
 		 524 aa  605  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  56.39 
 
 		 513 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  56.58 
 
 		 510 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  57.81 
 
 		 565 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  57.45 
 
 		 525 aa  601  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  57.53 
 
 		 520 aa  598  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  56.54 
 
 		 540 aa  598  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  56.64 
 
 		 520 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  57.03 
 
 		 520 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  57.53 
 
 		 531 aa  595  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3189  GMP synthase  58.98 
 
 		 540 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  56.89 
 
 		 526 aa  596  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  55.95 
 
 		 514 aa  595  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  55.95 
 
 		 514 aa  595  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  56.45 
 
 		 520 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  55.88 
 
 		 511 aa  593  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  54.72 
 
 		 515 aa  592  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  54.67 
 
 		 512 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  55.88 
 
 		 512 aa  592  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39720  GMP synthase  55.9 
 
 		 526 aa  588  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  55.9 
 
 		 530 aa  590  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  58.01 
 
 		 518 aa  588  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  54.42 
 
 		 509 aa  588  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  54.42 
 
 		 509 aa  590  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  55.9 
 
 		 519 aa  588  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  56.64 
 
 		 534 aa  588  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  55.36 
 
 		 510 aa  590  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3156  GMP synthase  56.64 
 
 		 521 aa  585  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0345833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  54.17 
 
 		 512 aa  585  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  56.64 
 
 		 521 aa  585  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  57.03 
 
 		 518 aa  585  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  54.31 
 
 		 511 aa  585  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.4 
 
 		 510 aa  585  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0634  GMP synthase  55.58 
 
 		 537 aa  586  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.324774 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  55.04 
 
 		 523 aa  585  1e-166  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2931  GMP synthase  56.84 
 
 		 521 aa  587  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.114397 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  55.51 
 
 		 513 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  53.52 
 
 		 510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  56.26 
 
 		 525 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  53.89 
 
 		 513 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  54.93 
 
 		 540 aa  582  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0378  GMP synthase, large subunit  57.03 
 
 		 534 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246609 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2895  GMP synthase, large subunit  56.87 
 
 		 533 aa  584  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.131714 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  56.16 
 
 		 523 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  54.03 
 
 		 512 aa  581  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  53.83 
 
 		 512 aa  581  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  53.83 
 
 		 512 aa  580  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  57.23 
 
 		 518 aa  580  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  54.31 
 
 		 508 aa  578  1e-164  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  56.03 
 
 		 513 aa  579  1e-164  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  55.15 
 
 		 511 aa  580  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  55.1 
 
 		 518 aa  579  1e-164  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  53.63 
 
 		 512 aa  580  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  55.06 
 
 		 533 aa  579  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1032  GMP synthase  54.35 
 
 		 525 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  53.53 
 
 		 511 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  54.74 
 
 		 513 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1450  GMP synthase  54.74 
 
 		 525 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0677657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  53.44 
 
 		 515 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  53.44 
 
 		 515 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  53.44 
 
 		 515 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1262  GMP synthase  54.35 
 
 		 525 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4193  GMP synthase  54.35 
 
 		 525 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1030  GMP synthase  54.35 
 
 		 525 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  55.86 
 
 		 520 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  53.44 
 
 		 512 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1347  GMP synthase  54.74 
 
 		 527 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  54.07 
 
 		 575 aa  577  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  56.7 
 
 		 513 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  54.74 
 
 		 525 aa  575  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  55.8 
 
 		 506 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3485  GMP synthase  54.16 
 
 		 525 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15340  GMP synthase  54.55 
 
 		 525 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000261534  hitchhiker  2.19845e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  53.05 
 
 		 515 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>