More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1628 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  63.6 
 
 		 518 aa  674    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  60.08 
 
 		 511 aa  635    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  100 
 
 		 511 aa  1044    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  61.54 
 
 		 513 aa  660    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  60.39 
 
 		 512 aa  639    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  60.55 
 
 		 511 aa  642    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  60.89 
 
 		 514 aa  656    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  60.16 
 
 		 510 aa  639    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  60.39 
 
 		 515 aa  640    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  60.39 
 
 		 515 aa  642    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  60.39 
 
 		 515 aa  640    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  60.98 
 
 		 512 aa  648    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  60.36 
 
 		 513 aa  646    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0477  GMP synthase  60.16 
 
 		 511 aa  641    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  59.38 
 
 		 513 aa  635    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  62.62 
 
 		 507 aa  637    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  62.92 
 
 		 512 aa  659    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  60.39 
 
 		 512 aa  640    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  62.13 
 
 		 510 aa  646    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  61.76 
 
 		 525 aa  642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  60.55 
 
 		 511 aa  652    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  63.51 
 
 		 516 aa  684    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  60.39 
 
 		 512 aa  640    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  60.27 
 
 		 516 aa  642    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  60.89 
 
 		 514 aa  656    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  59.96 
 
 		 516 aa  653    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  63.41 
 
 		 518 aa  656    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  64.5 
 
 		 517 aa  690    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  60 
 
 		 512 aa  637    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  60.36 
 
 		 511 aa  643    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  61.93 
 
 		 512 aa  642    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  62.52 
 
 		 510 aa  665    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  60.62 
 
 		 515 aa  640    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  60.39 
 
 		 512 aa  643    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  60.59 
 
 		 512 aa  643    Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  59.37 
 
 		 509 aa  635    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  60.55 
 
 		 511 aa  650    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  63.01 
 
 		 518 aa  655    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  61.49 
 
 		 522 aa  667    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  64.57 
 
 		 518 aa  691    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  63.12 
 
 		 514 aa  677    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  63.51 
 
 		 516 aa  683    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  64.69 
 
 		 516 aa  692    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  63.01 
 
 		 518 aa  654    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  60.39 
 
 		 515 aa  639    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  59.88 
 
 		 511 aa  631  1e-180  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  59.17 
 
 		 509 aa  634  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  60.83 
 
 		 511 aa  634  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  59.96 
 
 		 510 aa  632  1e-180  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0638  GMP synthase  58.97 
 
 		 511 aa  630  1e-179  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  58.66 
 
 		 509 aa  628  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  59.77 
 
 		 513 aa  629  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  57.78 
 
 		 540 aa  629  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  58.25 
 
 		 512 aa  630  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  60.35 
 
 		 513 aa  629  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  57 
 
 		 542 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  57.59 
 
 		 575 aa  627  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  58.4 
 
 		 512 aa  627  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  57 
 
 		 542 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  58.51 
 
 		 511 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1555  GMP synthase  58.9 
 
 		 510 aa  624  1e-177  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  56.23 
 
 		 542 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  60.04 
 
 		 511 aa  624  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  59.02 
 
 		 515 aa  622  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  59.65 
 
 		 517 aa  622  1e-177  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  60.63 
 
 		 510 aa  621  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  58.65 
 
 		 514 aa  619  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0634  GMP synthase  58.33 
 
 		 537 aa  619  1e-176  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.324774 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  58.97 
 
 		 506 aa  620  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  59.73 
 
 		 513 aa  619  1e-176  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  57.59 
 
 		 540 aa  619  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  57.79 
 
 		 513 aa  616  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  59.1 
 
 		 520 aa  615  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  58.38 
 
 		 513 aa  616  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  59.88 
 
 		 523 aa  616  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  58.38 
 
 		 513 aa  616  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  59.45 
 
 		 560 aa  615  1e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  58.94 
 
 		 515 aa  615  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  59.06 
 
 		 533 aa  612  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  57.34 
 
 		 526 aa  613  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  59.14 
 
 		 515 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  57.03 
 
 		 518 aa  612  9.999999999999999e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  55.84 
 
 		 575 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0940  GMP synthase  57.93 
 
 		 510 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  58.9 
 
 		 520 aa  612  9.999999999999999e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  58.71 
 
 		 519 aa  613  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  59.1 
 
 		 520 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  58.51 
 
 		 531 aa  611  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  57.48 
 
 		 530 aa  608  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  58.27 
 
 		 510 aa  611  1e-173  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  56.45 
 
 		 512 aa  610  1e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  57.83 
 
 		 513 aa  610  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  55.64 
 
 		 537 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  58.17 
 
 		 521 aa  611  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  57.59 
 
 		 528 aa  609  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  58.27 
 
 		 517 aa  611  1e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2931  GMP synthase  57.39 
 
 		 521 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.114397 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  57.93 
 
 		 540 aa  607  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3156  GMP synthase  57.59 
 
 		 521 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0345833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  58.15 
 
 		 515 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>