More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1739 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  78.24 
 
 		 513 aa  802    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  62.91 
 
 		 522 aa  636    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  100 
 
 		 512 aa  1032    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  61.13 
 
 		 516 aa  641    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  92.97 
 
 		 512 aa  964    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3478  GMP synthase  71.62 
 
 		 514 aa  741    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  60.67 
 
 		 510 aa  638    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  58.75 
 
 		 533 aa  627  1e-178  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  58.4 
 
 		 511 aa  627  1e-178  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  58.56 
 
 		 560 aa  627  1e-178  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  58.75 
 
 		 560 aa  625  1e-178  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  58.51 
 
 		 512 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  62.52 
 
 		 518 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  60.67 
 
 		 518 aa  618  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  61.22 
 
 		 506 aa  616  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  60.58 
 
 		 530 aa  613  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  59.65 
 
 		 540 aa  611  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  57.84 
 
 		 516 aa  609  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  59.03 
 
 		 556 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  62.06 
 
 		 518 aa  611  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  61.87 
 
 		 518 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  58.64 
 
 		 565 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  57.53 
 
 		 510 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  58.4 
 
 		 513 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  59.42 
 
 		 514 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  62.26 
 
 		 518 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  59.42 
 
 		 514 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0634  GMP synthase  58.11 
 
 		 537 aa  605  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.324774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  57.31 
 
 		 519 aa  606  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  58.64 
 
 		 534 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  57.34 
 
 		 531 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  55.38 
 
 		 512 aa  600  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  55.38 
 
 		 512 aa  598  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  55.19 
 
 		 515 aa  598  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  55.19 
 
 		 512 aa  598  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  57.69 
 
 		 520 aa  600  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  57.98 
 
 		 535 aa  599  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  58.37 
 
 		 526 aa  599  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  59.53 
 
 		 518 aa  599  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  56.86 
 
 		 516 aa  598  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  56.67 
 
 		 517 aa  600  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  59.06 
 
 		 533 aa  599  1e-170  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  56.67 
 
 		 516 aa  598  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  54.99 
 
 		 512 aa  597  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  55.19 
 
 		 515 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  55.19 
 
 		 515 aa  597  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  59.65 
 
 		 520 aa  595  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  55.19 
 
 		 512 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  55.77 
 
 		 513 aa  596  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  55.77 
 
 		 513 aa  596  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  54.99 
 
 		 515 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  57.06 
 
 		 525 aa  595  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  54.71 
 
 		 514 aa  597  1e-169  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  56.92 
 
 		 520 aa  596  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  55.19 
 
 		 512 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  58.56 
 
 		 528 aa  598  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  55.19 
 
 		 512 aa  594  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  55.69 
 
 		 517 aa  594  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  57.12 
 
 		 520 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  59.14 
 
 		 518 aa  592  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  59.81 
 
 		 534 aa  592  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  58.27 
 
 		 522 aa  594  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.1 
 
 		 517 aa  591  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  57.59 
 
 		 535 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  55.08 
 
 		 511 aa  593  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  55.84 
 
 		 537 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  55.29 
 
 		 517 aa  594  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  55.38 
 
 		 510 aa  590  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  58.87 
 
 		 520 aa  588  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  54.79 
 
 		 513 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  58.37 
 
 		 524 aa  590  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  56.34 
 
 		 520 aa  589  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  56.34 
 
 		 520 aa  591  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  56.34 
 
 		 523 aa  588  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  59.23 
 
 		 556 aa  590  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3189  GMP synthase  57.86 
 
 		 540 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3211  GMP synthase  59.53 
 
 		 541 aa  591  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  57.03 
 
 		 540 aa  590  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  56.89 
 
 		 519 aa  590  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  55.31 
 
 		 509 aa  588  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  54.79 
 
 		 513 aa  587  1e-166  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  54.69 
 
 		 511 aa  586  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  55.75 
 
 		 525 aa  585  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  59.03 
 
 		 525 aa  587  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  55.75 
 
 		 525 aa  587  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  54.71 
 
 		 517 aa  587  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  54.26 
 
 		 575 aa  587  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1138  GMP synthase  55.6 
 
 		 525 aa  586  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.045866  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  58.48 
 
 		 520 aa  585  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  55.75 
 
 		 520 aa  585  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  55.75 
 
 		 520 aa  584  1.0000000000000001e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  55.94 
 
 		 525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  55.36 
 
 		 525 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  59.26 
 
 		 520 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  55.36 
 
 		 525 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  55.94 
 
 		 525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3485  GMP synthase  56.4 
 
 		 525 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  56.21 
 
 		 525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39720  GMP synthase  57.17 
 
 		 526 aa  584  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3123  GMP synthase  54.6 
 
 		 525 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>