More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3478 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  71.88 
 
 
513 aa  752    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  71.23 
 
 
512 aa  754    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  71.62 
 
 
512 aa  759    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3478  GMP synthase  100 
 
 
514 aa  1053    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  60.12 
 
 
518 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  58.43 
 
 
516 aa  621  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  58.51 
 
 
533 aa  619  1e-176  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  58.2 
 
 
525 aa  619  1e-176  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  60.85 
 
 
518 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  58.32 
 
 
560 aa  620  1e-176  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  59.84 
 
 
518 aa  619  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  57.78 
 
 
560 aa  617  1e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  58.59 
 
 
510 aa  617  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  60.66 
 
 
518 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  60.66 
 
 
518 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  58.35 
 
 
511 aa  611  9.999999999999999e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  57.62 
 
 
510 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  60.34 
 
 
522 aa  610  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  56.84 
 
 
517 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  57.86 
 
 
520 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  55.13 
 
 
517 aa  606  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  55.51 
 
 
517 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  56.45 
 
 
516 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  55.66 
 
 
516 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.93 
 
 
517 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  55.86 
 
 
516 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  55.13 
 
 
517 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  57.12 
 
 
523 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  56.45 
 
 
512 aa  599  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  56.07 
 
 
520 aa  598  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  55.17 
 
 
511 aa  598  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  56.89 
 
 
520 aa  600  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  57.62 
 
 
531 aa  597  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  55.95 
 
 
520 aa  597  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  54.47 
 
 
513 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  58.06 
 
 
518 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0634  GMP synthase  56.18 
 
 
537 aa  598  1e-169  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.324774 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  55.17 
 
 
511 aa  595  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  55.95 
 
 
520 aa  597  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  58.37 
 
 
518 aa  595  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  57.09 
 
 
520 aa  593  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  56.31 
 
 
530 aa  592  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  57.36 
 
 
525 aa  593  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  56.7 
 
 
522 aa  593  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  55.62 
 
 
526 aa  592  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  56.16 
 
 
513 aa  594  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  56.08 
 
 
525 aa  594  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  54.88 
 
 
513 aa  589  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  56.54 
 
 
520 aa  590  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  55.05 
 
 
525 aa  591  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  55.53 
 
 
540 aa  588  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  54.29 
 
 
525 aa  588  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  56.89 
 
 
506 aa  588  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  55.13 
 
 
519 aa  589  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0638  GMP synthase  55.36 
 
 
511 aa  591  1e-167  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  54.67 
 
 
525 aa  585  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.34 
 
 
510 aa  586  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  54.3 
 
 
513 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  54.49 
 
 
512 aa  587  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1269  GMP synthase  54.1 
 
 
525 aa  585  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0189098  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  56.92 
 
 
533 aa  585  1e-166  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  54.3 
 
 
513 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  55 
 
 
520 aa  586  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  55 
 
 
520 aa  586  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  56.2 
 
 
528 aa  585  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  55.43 
 
 
518 aa  585  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  57.53 
 
 
520 aa  585  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  54.74 
 
 
525 aa  586  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  55.45 
 
 
556 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  54.49 
 
 
512 aa  587  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  54.53 
 
 
511 aa  585  1e-166  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  54.33 
 
 
509 aa  587  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  54.13 
 
 
509 aa  585  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  53.29 
 
 
575 aa  585  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  54.6 
 
 
510 aa  586  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  54.67 
 
 
525 aa  585  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  54.67 
 
 
525 aa  586  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  55.64 
 
 
511 aa  586  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  53.79 
 
 
514 aa  587  1e-166  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  54.1 
 
 
525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  55.13 
 
 
526 aa  584  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  54.1 
 
 
525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  54.74 
 
 
525 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  54.1 
 
 
525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  54.1 
 
 
525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  54.1 
 
 
512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  54.1 
 
 
525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  55.3 
 
 
525 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  54.3 
 
 
512 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  54.7 
 
 
542 aa  584  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  54.1 
 
 
525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  54.1 
 
 
515 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  54.1 
 
 
525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  54.1 
 
 
525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  54.55 
 
 
525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  54.53 
 
 
528 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  57.39 
 
 
514 aa  581  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  54.29 
 
 
525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  54.93 
 
 
525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  57.39 
 
 
514 aa  581  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>