More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0375 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  62.94 
 
 		 512 aa  682    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  62.55 
 
 		 512 aa  677    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  62.94 
 
 		 512 aa  683    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  64.64 
 
 		 523 aa  699    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  61.3 
 
 		 513 aa  662    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  60.43 
 
 		 516 aa  649    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  62.55 
 
 		 512 aa  676    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  64.77 
 
 		 510 aa  704    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  62.75 
 
 		 512 aa  680    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  60.12 
 
 		 520 aa  637    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  60.43 
 
 		 517 aa  661    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  59.88 
 
 		 510 aa  649    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  63.28 
 
 		 510 aa  657    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  62.75 
 
 		 515 aa  680    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  62.75 
 
 		 515 aa  681    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  62.75 
 
 		 515 aa  680    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  63.46 
 
 		 513 aa  686    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  63.99 
 
 		 510 aa  698    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  71.04 
 
 		 511 aa  770    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  64.24 
 
 		 512 aa  688    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  62.94 
 
 		 512 aa  681    Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  60.55 
 
 		 514 aa  639    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  61.69 
 
 		 513 aa  660    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  62.75 
 
 		 512 aa  680    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  70.41 
 
 		 507 aa  773    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  61.1 
 
 		 509 aa  647    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  63.41 
 
 		 510 aa  686    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  65.35 
 
 		 516 aa  704    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  61.69 
 
 		 513 aa  660    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  71.85 
 
 		 508 aa  773    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  59.45 
 
 		 516 aa  652    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  59.22 
 
 		 510 aa  634    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  62.55 
 
 		 515 aa  675    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  61.74 
 
 		 517 aa  651    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  100 
 
 		 511 aa  1048    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  64.64 
 
 		 513 aa  700    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  69.88 
 
 		 509 aa  742    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  70.08 
 
 		 509 aa  742    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  63.71 
 
 		 517 aa  668    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  60.12 
 
 		 520 aa  641    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  59.53 
 
 		 518 aa  646    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  62.62 
 
 		 512 aa  669    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  59.84 
 
 		 516 aa  652    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  79.84 
 
 		 511 aa  865    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  60.83 
 
 		 511 aa  634  1e-180  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  57.69 
 
 		 542 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  57.25 
 
 		 518 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  57.69 
 
 		 542 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  56.92 
 
 		 575 aa  625  1e-178  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  57.79 
 
 		 506 aa  626  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  56.54 
 
 		 542 aa  626  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  60.67 
 
 		 510 aa  626  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  57.48 
 
 		 533 aa  627  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  56.73 
 
 		 537 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  57.12 
 
 		 540 aa  622  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  57.68 
 
 		 513 aa  624  1e-177  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  56.48 
 
 		 556 aa  620  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  56.35 
 
 		 575 aa  618  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  56.89 
 
 		 534 aa  616  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  57.06 
 
 		 518 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  57.25 
 
 		 518 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  57.36 
 
 		 528 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  57.36 
 
 		 528 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  57.25 
 
 		 518 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  57.12 
 
 		 540 aa  614  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  57.39 
 
 		 520 aa  612  9.999999999999999e-175  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  56.64 
 
 		 533 aa  608  1e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  56.45 
 
 		 560 aa  608  1e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  57.77 
 
 		 520 aa  610  1e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  56.78 
 
 		 528 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  56.45 
 
 		 560 aa  606  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  57.36 
 
 		 528 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  56.98 
 
 		 533 aa  607  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  56.65 
 
 		 528 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  57.47 
 
 		 522 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  57.75 
 
 		 528 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  56.84 
 
 		 528 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  55.9 
 
 		 520 aa  598  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  55.79 
 
 		 528 aa  600  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  56.09 
 
 		 520 aa  599  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  57.17 
 
 		 528 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1123  GMP synthase  57.28 
 
 		 517 aa  599  1e-170  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  57.75 
 
 		 528 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  55.58 
 
 		 527 aa  597  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  54.28 
 
 		 525 aa  596  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  55.45 
 
 		 514 aa  596  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  55.45 
 
 		 514 aa  596  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  55.41 
 
 		 526 aa  592  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  56.65 
 
 		 523 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  56.09 
 
 		 526 aa  593  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  53.92 
 
 		 509 aa  594  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  55.08 
 
 		 512 aa  593  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4147  GMP synthase  56.87 
 
 		 525 aa  593  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.712191  normal  0.0751509 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  55.32 
 
 		 520 aa  593  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6529  GMP synthase  55.62 
 
 		 519 aa  592  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413067  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  55.25 
 
 		 517 aa  591  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  55.17 
 
 		 525 aa  589  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.2 
 
 		 526 aa  590  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  55.07 
 
 		 529 aa  590  1e-167  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  54.99 
 
 		 516 aa  591  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>