More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1616 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  63.01 
 
 		 511 aa  669    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  61.12 
 
 		 517 aa  684    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  65.76 
 
 		 514 aa  687    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3211  GMP synthase  62.84 
 
 		 541 aa  649    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  59.5 
 
 		 510 aa  642    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  61.3 
 
 		 518 aa  637    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  61.97 
 
 		 530 aa  636    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  62.31 
 
 		 522 aa  650    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  58.3 
 
 		 514 aa  667    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  61.7 
 
 		 516 aa  692    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  61.35 
 
 		 525 aa  636    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  63.42 
 
 		 516 aa  665    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  59.5 
 
 		 510 aa  635    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  98.07 
 
 		 518 aa  1030    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  87.64 
 
 		 518 aa  929    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  61.97 
 
 		 516 aa  688    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  62.84 
 
 		 518 aa  637    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  59.23 
 
 		 515 aa  636    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  100 
 
 		 518 aa  1044    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  62.48 
 
 		 526 aa  662    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  59.92 
 
 		 520 aa  638    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  65.76 
 
 		 514 aa  687    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  63.44 
 
 		 518 aa  684    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  61.97 
 
 		 516 aa  688    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  99.42 
 
 		 518 aa  1039    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  63.86 
 
 		 525 aa  650    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  58.3 
 
 		 512 aa  633  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  59.92 
 
 		 520 aa  632  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  59.73 
 
 		 515 aa  634  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  59.5 
 
 		 516 aa  632  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  58.79 
 
 		 511 aa  632  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  60.96 
 
 		 556 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  60.5 
 
 		 519 aa  631  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  61.48 
 
 		 513 aa  632  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  60.12 
 
 		 520 aa  632  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  60.31 
 
 		 523 aa  633  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  59.34 
 
 		 520 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  60.12 
 
 		 520 aa  629  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  60.12 
 
 		 520 aa  628  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  58.62 
 
 		 520 aa  628  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  60.54 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  57.88 
 
 		 515 aa  631  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  57.25 
 
 		 511 aa  630  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  62.26 
 
 		 518 aa  630  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  60.42 
 
 		 540 aa  629  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  60.69 
 
 		 521 aa  628  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  58.72 
 
 		 515 aa  630  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  55.98 
 
 		 512 aa  627  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  55.79 
 
 		 512 aa  625  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  55.98 
 
 		 512 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  56.34 
 
 		 515 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  56.34 
 
 		 515 aa  626  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  56.34 
 
 		 515 aa  626  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  58.51 
 
 		 511 aa  627  1e-178  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  56.18 
 
 		 512 aa  627  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  59.19 
 
 		 534 aa  627  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  56.18 
 
 		 512 aa  625  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  55.98 
 
 		 512 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  57.48 
 
 		 516 aa  625  1e-178  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  56.14 
 
 		 515 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  62.45 
 
 		 512 aa  625  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  62.74 
 
 		 520 aa  627  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  59.27 
 
 		 519 aa  627  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  60.38 
 
 		 565 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3156  GMP synthase  60.31 
 
 		 521 aa  625  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0345833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2931  GMP synthase  60.69 
 
 		 521 aa  627  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.114397 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  58.11 
 
 		 517 aa  623  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  55.98 
 
 		 512 aa  623  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.11 
 
 		 517 aa  622  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  58.73 
 
 		 528 aa  622  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  61.87 
 
 		 512 aa  622  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  59.24 
 
 		 522 aa  623  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  59.85 
 
 		 540 aa  623  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  58.9 
 
 		 526 aa  622  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0634  GMP synthase  60.15 
 
 		 537 aa  624  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.324774 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  58.4 
 
 		 509 aa  622  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  57.34 
 
 		 517 aa  620  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2895  GMP synthase, large subunit  60.23 
 
 		 533 aa  619  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.131714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3189  GMP synthase  60.38 
 
 		 540 aa  621  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  59.96 
 
 		 535 aa  621  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  57.2 
 
 		 513 aa  621  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0378  GMP synthase, large subunit  60.77 
 
 		 534 aa  620  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246609 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  59.69 
 
 		 520 aa  615  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  58.3 
 
 		 518 aa  616  1e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  57.53 
 
 		 509 aa  615  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3478  GMP synthase  60.66 
 
 		 514 aa  615  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  59.5 
 
 		 520 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  56.29 
 
 		 511 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  58.44 
 
 		 525 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  56.36 
 
 		 511 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  58.43 
 
 		 521 aa  612  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  58.17 
 
 		 525 aa  611  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  57.86 
 
 		 515 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  56.37 
 
 		 513 aa  610  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  57.87 
 
 		 525 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  57.87 
 
 		 525 aa  608  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  59.27 
 
 		 524 aa  610  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1560  GMP synthase  56.93 
 
 		 525 aa  608  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  55.9 
 
 		 511 aa  610  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  56.03 
 
 		 510 aa  611  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>