More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0959 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  100 
 
 
531 aa  1088    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  59.34 
 
 
533 aa  628  1e-179  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  59.8 
 
 
560 aa  630  1e-179  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  58.95 
 
 
560 aa  624  1e-178  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  57.17 
 
 
516 aa  621  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  60.98 
 
 
511 aa  622  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  58.32 
 
 
513 aa  618  1e-176  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  58.51 
 
 
511 aa  617  1e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  57.53 
 
 
512 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  57.34 
 
 
512 aa  608  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  56.16 
 
 
510 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  57.34 
 
 
516 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  55.3 
 
 
517 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  56.53 
 
 
513 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  57.93 
 
 
512 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  58.32 
 
 
510 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  57.73 
 
 
510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  57.53 
 
 
515 aa  599  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  56.36 
 
 
516 aa  600  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  56.16 
 
 
516 aa  599  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  56.59 
 
 
515 aa  599  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  54.27 
 
 
528 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  56.86 
 
 
512 aa  597  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  54.68 
 
 
537 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  56.47 
 
 
515 aa  595  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  57.48 
 
 
513 aa  597  1e-169  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  56.27 
 
 
506 aa  596  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  56.47 
 
 
512 aa  593  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  56.47 
 
 
512 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  56.47 
 
 
515 aa  594  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  56.47 
 
 
515 aa  594  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  56.47 
 
 
515 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  57.28 
 
 
522 aa  593  1e-168  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  56.19 
 
 
514 aa  592  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  56.47 
 
 
512 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  56.27 
 
 
512 aa  592  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3478  GMP synthase  57.62 
 
 
514 aa  592  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  53.35 
 
 
575 aa  593  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  56.47 
 
 
512 aa  593  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  55.8 
 
 
510 aa  592  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  54.74 
 
 
528 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  56.27 
 
 
512 aa  592  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  54.62 
 
 
513 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  54.35 
 
 
540 aa  591  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  53.51 
 
 
528 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  54.55 
 
 
575 aa  591  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  56.07 
 
 
556 aa  588  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  54.35 
 
 
540 aa  590  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  53.51 
 
 
528 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  56.42 
 
 
533 aa  585  1e-166  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  56.95 
 
 
534 aa  587  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.67 
 
 
510 aa  587  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  56.19 
 
 
509 aa  585  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  56.19 
 
 
509 aa  587  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  53.38 
 
 
542 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  53.42 
 
 
517 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  55.21 
 
 
509 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  54.65 
 
 
528 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  55.75 
 
 
522 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  55.19 
 
 
512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  55.21 
 
 
511 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  56.27 
 
 
511 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  54.35 
 
 
517 aa  581  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  53.77 
 
 
542 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.84 
 
 
517 aa  578  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  56.05 
 
 
516 aa  579  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  55.47 
 
 
528 aa  580  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  55.23 
 
 
515 aa  578  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  55.8 
 
 
518 aa  581  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  53.77 
 
 
542 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  53.03 
 
 
517 aa  580  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  52.78 
 
 
528 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  53.97 
 
 
528 aa  577  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  53.68 
 
 
528 aa  575  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  52.78 
 
 
528 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  55.58 
 
 
515 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  53.44 
 
 
517 aa  575  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  52.84 
 
 
517 aa  575  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  57 
 
 
510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  54.65 
 
 
517 aa  571  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  54.34 
 
 
528 aa  570  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  54.83 
 
 
520 aa  570  1e-161  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  52.22 
 
 
525 aa  570  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.83 
 
 
510 aa  570  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  52.61 
 
 
525 aa  570  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  54.07 
 
 
515 aa  571  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  52.13 
 
 
525 aa  568  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  52.22 
 
 
525 aa  565  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  55.3 
 
 
527 aa  565  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  52.72 
 
 
520 aa  566  1e-160  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1269  GMP synthase  51.45 
 
 
525 aa  565  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0189098  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  52.22 
 
 
525 aa  565  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  52.22 
 
 
525 aa  565  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  54.22 
 
 
513 aa  567  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  52.22 
 
 
525 aa  566  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  54.28 
 
 
556 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  53.76 
 
 
523 aa  567  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  54.22 
 
 
513 aa  567  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  52.22 
 
 
525 aa  565  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  53.73 
 
 
511 aa  565  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>