More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0677 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  62.5 
 
 		 518 aa  639    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  60.19 
 
 		 516 aa  656    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  59.23 
 
 		 517 aa  654    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  61.49 
 
 		 511 aa  667    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  59.42 
 
 		 516 aa  650    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  62.91 
 
 		 512 aa  636    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  62.12 
 
 		 518 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  62.31 
 
 		 518 aa  659    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  62.31 
 
 		 518 aa  636    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  59.42 
 
 		 516 aa  651    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  62.91 
 
 		 518 aa  664    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  63.86 
 
 		 512 aa  646    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  100 
 
 		 522 aa  1058    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  57.31 
 
 		 514 aa  639    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  57.28 
 
 		 511 aa  628  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  58.19 
 
 		 513 aa  624  1e-177  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  58.71 
 
 		 513 aa  622  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  59.74 
 
 		 513 aa  622  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  58.71 
 
 		 513 aa  620  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  60 
 
 		 526 aa  621  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  56.87 
 
 		 515 aa  620  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  58.4 
 
 		 520 aa  616  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  58.48 
 
 		 514 aa  617  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  58.48 
 
 		 514 aa  617  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  58.4 
 
 		 515 aa  615  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  59.89 
 
 		 525 aa  615  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  59.73 
 
 		 540 aa  617  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  58.78 
 
 		 520 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  56.9 
 
 		 518 aa  615  1e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  59.89 
 
 		 530 aa  615  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  58.13 
 
 		 518 aa  616  1e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  59.05 
 
 		 518 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  58.56 
 
 		 511 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  58.54 
 
 		 515 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  58.4 
 
 		 520 aa  613  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  58.78 
 
 		 519 aa  613  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  58.75 
 
 		 519 aa  614  9.999999999999999e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  58.65 
 
 		 513 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3211  GMP synthase  59.81 
 
 		 541 aa  611  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  57.9 
 
 		 535 aa  608  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2697  GMP synthase  56.76 
 
 		 509 aa  610  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  57.99 
 
 		 527 aa  610  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  58.29 
 
 		 535 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  55.88 
 
 		 509 aa  611  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  58.37 
 
 		 556 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  56.95 
 
 		 540 aa  608  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6854  GMP synthase  56.33 
 
 		 512 aa  610  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.727816  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  57.97 
 
 		 515 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  58.93 
 
 		 522 aa  605  9.999999999999999e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  57.98 
 
 		 565 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  57.63 
 
 		 520 aa  607  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2931  GMP synthase  59.43 
 
 		 521 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.114397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  59.24 
 
 		 521 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  56.36 
 
 		 575 aa  606  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  57.88 
 
 		 527 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3156  GMP synthase  59.43 
 
 		 521 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0345833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0934  GMP synthase  55.64 
 
 		 509 aa  605  9.999999999999999e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0445641  normal  0.514334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0378  GMP synthase, large subunit  58.06 
 
 		 534 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  59.05 
 
 		 524 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  58.02 
 
 		 523 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  58.51 
 
 		 525 aa  604  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  59.16 
 
 		 520 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  57.47 
 
 		 511 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  56.51 
 
 		 511 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0634  GMP synthase  58.22 
 
 		 537 aa  601  1.0000000000000001e-171  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.324774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  54.73 
 
 		 575 aa  602  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0993  GMP synthase  56.02 
 
 		 508 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3478  GMP synthase  60.34 
 
 		 514 aa  600  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2862  GMP synthase, large subunit  56.76 
 
 		 510 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.56979 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  54.51 
 
 		 512 aa  598  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  58.21 
 
 		 520 aa  598  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  54.51 
 
 		 515 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  54.51 
 
 		 515 aa  600  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  54.51 
 
 		 515 aa  599  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  57.06 
 
 		 514 aa  598  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  54.51 
 
 		 512 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  57.66 
 
 		 516 aa  600  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  55.41 
 
 		 542 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  54.51 
 
 		 512 aa  599  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  58.21 
 
 		 520 aa  599  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  57.01 
 
 		 510 aa  601  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  59.31 
 
 		 513 aa  598  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  59.81 
 
 		 518 aa  600  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  54.7 
 
 		 512 aa  598  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  57.63 
 
 		 520 aa  600  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  55.41 
 
 		 542 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  55.05 
 
 		 512 aa  600  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  54.7 
 
 		 512 aa  601  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  56.24 
 
 		 512 aa  597  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  54.32 
 
 		 512 aa  596  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  59.05 
 
 		 518 aa  598  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  56.03 
 
 		 527 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  57.82 
 
 		 520 aa  596  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  56.11 
 
 		 516 aa  597  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3189  GMP synthase  58.37 
 
 		 540 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  56.35 
 
 		 515 aa  595  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  54.32 
 
 		 515 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  54.89 
 
 		 512 aa  597  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  53.98 
 
 		 542 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  55.24 
 
 		 540 aa  593  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>